RNA–Protein interactions for RNA: YPL253C

VIK1, Transcript of Protein that forms a kinesin-14 heterodimeric motor with Kar3p, yeast

Gene VIK1, Length 1,944 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	YPL253C	APL3	P38065	1025 aa		2.25	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	APN2	P38207	520 aa		2.25	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	IRC8	P47046	822 aa		2.25	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	RFX1	P48743	811 aa		2.25	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	PMT6	P42934	759 aa		2.25	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	RKI1	Q12189	258 aa		2.25	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	TPK2	P06245	380 aa		2.24	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	GSY1	P23337	708 aa		2.24	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	VBA3	P25594	458 aa		2.24	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	MNN4	P36044	1178 aa		2.24	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	YIL077C	P40508	320 aa		2.24	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	DIP5	P53388	608 aa		2.24	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	ARG7	Q04728	441 aa		2.24	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	CIT2	P08679	460 aa		2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	SRD1	P09007	221 aa		2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	MEF1	P25039	761 aa		2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	YPT7	P32939	208 aa		2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	HOT13	P36078	116 aa		2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	SNF12	P53628	566 aa		2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	YFT2	Q06676	274 aa		2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	POM34	Q12445	299 aa		2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	NTH1	P32356	751 aa		2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	YEL1	P34225	687 aa		2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	UFO1	Q04511	668 aa		2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	YOR131C	Q12486	218 aa		2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		2.23	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	COS111	P38308	924 aa		2.22	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	DSS1	P39112	969 aa		2.22	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	YJR039W	P47107	1121 aa		2.22	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	YGL117W	P53133	265 aa		2.22	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	VPS36	Q06696	566 aa		2.22	□□□□□ -2.05
VIK1	YPL253C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	AAD3	P25612	363 aa		2.21	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	TIM23	P32897	222 aa		2.21	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	YHR202W	P38887	602 aa		2.21	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	BIT61	P47041	543 aa		2.21	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	PIP2	P52960	996 aa		2.21	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	ATG33	Q06485	197 aa		2.21	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	IZH3	Q07959	543 aa		2.21	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	DCS2	Q12123	353 aa		2.21	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	ELF1	P36053	145 aa		2.21	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	RPN4	Q03465	531 aa		2.21	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	FRE7	Q12333	620 aa		2.21	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	2.2	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	SEC15	P22224	910 aa		2.2	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	KIN82	P25341	720 aa		2.2	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	PCL2	P25693	308 aa		2.2	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	PET127	P32606	800 aa		2.2	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	NNF1	P47149	201 aa		2.2	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	AIM14	P53109	570 aa		2.2	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	CPR8	P53728	308 aa		2.2	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	2.2	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	COG8	Q04632	607 aa		2.2	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	VHS3	Q08438	674 aa		2.2	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	YOL098C	Q12496	1037 aa		2.2	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	HMG1	P12683	1054 aa		2.19	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	2.19	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	BEM4	P39011	633 aa		2.19	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	2.19	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	BUD6	P41697	788 aa		2.19	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	MAF1	P41910	395 aa		2.19	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	PMA2	P19657	947 aa		2.19	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	MSH2	P25847	964 aa		2.19	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	PEX6	P33760	1030 aa		2.19	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	PXL1	P36166	706 aa		2.19	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.19	□□□□□ -2.06	not detected
VIK1	YPL253C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	2.19	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	2.19	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	UGO1	Q03327	502 aa		2.19	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	ORM2	Q06144	216 aa		2.19	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	GIN4	Q12263	1142 aa		2.19	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	2.18	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	2.18	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	TRS23	Q03784	219 aa		2.18	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	SFL1	P20134	766 aa		2.17	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	BEM3	P32873	1128 aa		2.17	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	NUP82	P40368	713 aa		2.17	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	THI6	P41835	540 aa		2.17	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	IRC3	Q06683	689 aa		2.17	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	YLR125W	Q12138	136 aa		2.17	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	PHO8	P11491	566 aa		2.17	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	NMD5	P46970	1048 aa		2.17	□□□□□ -2.06
VIK1	YPL253C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.6 ms