RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	VPS45	P38932	577 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	VPS8	P39702	1274 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	BOL3	P39724	118 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	VAC8	P39968	578 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	GYP8	P43570	497 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	YJL049W	P47048	450 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	YML6	P51998	286 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	KAP114	P53067	1004 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	PEF1	P53238	335 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	SLT2	Q00772	484 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	YDR131C	Q03899	556 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	ARP10	Q04549	284 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	GMC2	Q06201	188 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	VIK1	Q12045	647 aa		5.73	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	YPR089W	O13585	888 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	CDC4	P07834	779 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	IMP2'	P32351	346 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	PXL1	P36166	706 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	RFC5	P38251	354 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	PBY1	P38254	753 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	FCY21	P40039	528 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	QDR2	P40474	542 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	BRE2	P43132	505 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	LIF1	P53150	421 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	UBX4	P54730	416 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	KAP120	Q02932	1032 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	TRS130	Q03660	1102 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	PRP28	P23394	588 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	ZIP1	P31111	875 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	COS111	P38308	924 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	COX16	P47081	118 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	GCV2	P49095	1034 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	MLC1	P53141	149 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	CGR1	P53188	120 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	USA1	Q03714	838 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	RTT103	Q05543	409 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	PIG1	Q06216	648 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	SGO1	Q08490	590 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	APL4	Q12028	832 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		5.72	□□□□□ -1.49
VBA1	YMR088C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YPK2	P18961	677 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	TYR1	P20049	452 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	PEX1	P24004	1043 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	DMC1	P25453	334 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	HIR1	P32479	840 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	SAW1	P39735	261 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	MAD3	P47074	515 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	POL32	P47110	350 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	CIK1	Q01649	594 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	FAR8	Q05040	523 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YCS4	Q06156	1176 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	DSE3	Q08729	430 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	ATG29	Q12092	213 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	LAG2	Q92325	660 aa		5.71	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	CYC8	P14922	966 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	SPE2	P21182	396 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	SPS22	P25380	463 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	LYP1	P32487	611 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	AFG2	P32794	780 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	CAF4	P36130	643 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	ILM1	P47155	203 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	TAF4	P50105	388 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	TEL2	P53038	688 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	GTR1	Q00582	310 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	YKR005C	Q02203	525 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	FIN1	Q03898	291 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	VPS64	Q03944	604 aa		5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
VBA1	YMR088C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.3 ms