RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	YKL050C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	MTF2	P10849	440 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	MER1	P16523	270 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	MSH3	P25336	1018 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	ERG3	P32353	365 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	HOG1	P32485	435 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	MIC60	P36112	540 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	UIP5	P36137	443 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	YBR225W	P38321	900 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	TDA3	P38758	523 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	IMA5	P40884	581 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	VID22	Q05934	901 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	GUP2	Q08929	609 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	MLS1	P30952	554 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SPT23	P35210	1082 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	RPC37	P36121	282 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	AXL2	P38928	823 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SHU2	P38957	223 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SAW1	P39735	261 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	RRT14	P40470	206 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	CIT3	P43635	486 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.97	□□□□□ -1.77	not detected
YKL050C	YKL050C	BNA2	P47125	453 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SAP4	P53036	818 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	CBK1	P53894	756 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	NCR1	Q12200	1170 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	YRM1	Q12340	786 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	LDB19	Q12502	818 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	HMG1	P12683	1054 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	CBP3	P21560	335 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	PRP28	P23394	588 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	YCL049C	P25577	312 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	RSC6	P25632	483 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	CBF2	P32504	956 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SMI1	P32566	505 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	SAP30	P38429	201 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	VPS45	P38932	577 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	FDC1	Q03034	503 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	PCL8	Q08966	492 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	IOC2	Q12072	812 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL050C	YKL050C	YPR117W	Q06116	2489 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	MOD5	P07884	428 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	HVG1	P0CE11	249 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	NTG1	P31378	399 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	MLF3	P32047	452 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	DUR3	P33413	735 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	PIM1	P36775	1133 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	RDH54	P38086	958 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	APM3	P38153	483 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	AGX1	P43567	385 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	NUP84	P52891	726 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	RRN5	Q02983	363 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	YML119W	Q03208	357 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	YDR131C	Q03899	556 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	RSC3	Q06639	885 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	RAV1	P47104	1357 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	NUC1	P08466	329 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	ROX1	P25042	368 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	SGF29	P25554	259 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	GPI10	P30777	616 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.96	□□□□□ -1.78	not detected
YKL050C	YKL050C	GIP1	P38229	639 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	SKP2	P42843	763 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	YJL055W	P47044	245 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	APM4	Q99186	491 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	OM45	P16547	393 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	KAR3	P17119	729 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	MRPL25	P23369	157 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	STE50	P25344	346 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	KAP122	P32767	1081 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	PPQ1	P32945	549 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
YKL050C	YKL050C	YER010C	P40011	234 aa		3.95	□□□□□ -1.78

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