RNA–Protein interactions for RNA: YGR102C

GTF1, Transcript of Subunit of the trimeric GatFAB AmidoTransferase(AdT) complex, yeast

Gene GTF1, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTF1	YGR102C	NHX1	Q04121	633 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	PHM6	Q05637	104 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	PER1	P25625	357 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	SSH4	P32343	579 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	EXO84	P38261	753 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	MSS4	P38994	779 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	HIS6	P40545	261 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	RET2	P43621	546 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	HXT16	P47185	567 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	SLD3	P53135	668 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	SKY1	Q03656	742 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	LAS17	Q12446	633 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	PSK1	P31374	1356 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GTF1	YGR102C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	YER158C	P40095	573 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	AIM21	P40563	679 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	YGR153W	P48238	217 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	NCS6	P53088	359 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	RRI2	Q12348	645 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	NPC2	Q12408	173 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	RSF2	P46974	1380 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	MIH1	P23748	554 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	DBF20	P32328	564 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	KTR4	P38131	464 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	HSL7	P38274	827 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	HXT7	P39004	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	ACA1	P39970	489 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	DOT5	P40553	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	YML131W	Q03102	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	ENT2	Q05785	613 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	SLM3	Q12093	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	APM4	Q99186	491 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	SPE2	P21182	396 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	TDA3	P38758	523 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	CHS7	P38843	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	SAP185	P40856	1058 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	MDG1	P53885	366 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	PEX15	Q08215	383 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	HFI1	Q12060	488 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	MSS18	P08593	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	KAR4	P25583	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	ALY2	P47029	1046 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	UPC2	Q12151	913 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	DAL7	P21826	554 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	RPC82	P32349	654 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	QRI7	P43122	407 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	TAD1	P53065	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	PHO81	P17442	1178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	RPD3	P32561	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	STE14	P32584	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	YKU70	P32807	602 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	OAF3	P36023	863 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	BUL1	P48524	976 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	YHM2	Q04013	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	RTP1	Q12751	981 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	DIF1	O13577	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	YCL002C	P25565	263 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	ATG19	P35193	415 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	NPR2	P39923	615 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	HOS4	P40480	1083 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	IES1	P43579	692 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	NPY1	P53164	384 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GTF1	YGR102C	CTF4	Q01454	927 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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