RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

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Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 ZNF408Q9H9D4 720 aa27.82■■■□□ 2.04
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SYT6-210ENST00000641643 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.8■■■□□ 2.04
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SYT6-210ENST00000641643 FGFR2P21802 821 aa27.79■■■□□ 2.04
SYT6-210ENST00000641643 CERS5Q8N5B7 392 aa27.79■■■□□ 2.04
SYT6-210ENST00000641643 CNTNAP1P78357 1384 aa27.79■■■□□ 2.04
SYT6-210ENST00000641643 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
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SYT6-210ENST00000641643 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP27.72■■■□□ 2.03
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SYT6-210ENST00000641643 CAPNS2Q96L46 248 aa27.66■■■□□ 2.02
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SYT6-210ENST00000641643 PHKA1P46020 1223 aa27.63■■■□□ 2.01
SYT6-210ENST00000641643 XAGE2Q96GT9 111 aa27.63■■■□□ 2.01
SYT6-210ENST00000641643 VEZTQ9HBM0 779 aa27.63■■■□□ 2.01
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SYT6-210ENST00000641643 SEMA3EO15041 775 aa27.62■■■□□ 2.01
SYT6-210ENST00000641643 GRIK5Q16478 980 aa27.62■■■□□ 2.01
SYT6-210ENST00000641643 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa27.62■■■□□ 2.01
SYT6-210ENST00000641643 MAST3O60307 1309 aa27.61■■■□□ 2.01
SYT6-210ENST00000641643 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
SYT6-210ENST00000641643 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
SYT6-210ENST00000641643 CRKP46108 304 aa27.61■■■□□ 2.01
SYT6-210ENST00000641643 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
SYT6-210ENST00000641643 GORABQ5T7V8 394 aa27.61■■■□□ 2.01
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