RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617649.4

ACACA-240, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 5 BASIC

Gene ACACA, Length 7,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-240	ENST00000617649	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	UBE2H	P62256	183 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	SYNM	O15061	1565 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	FAM13A	O94988	1023 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	STAMBP	O95630	424 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	SYK	P43405	635 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	TRIM47	Q96LD4	638 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	CEP83	Q9Y592	693 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	BICDL2	A1A5D9	508 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	SYCE3	A1L190	88 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	SPAG1	Q07617	926 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	KRT79	Q5XKE5	535 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	7.54	□□□□□ -1.2	1e-6	■■■■□ 19.5
ACACA-240	ENST00000617649	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	ORAI2	Q96SN7	254 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	ATP7B	P35670	1465 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	PSMA7	O14818	248 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	SSFA2	P28290	1259 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	TFCP2	Q12800	502 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	NOD1	Q9Y239	953 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	ARHGEF6	Q15052	776 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	PNMA2	Q9UL42	364 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	TAF12	Q16514	161 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	TRIM75P	A6NK02	468 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	SDS	P20132	328 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649		Q6ZUG5	572 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	FBLN1	P23142	703 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	PPP1R2	P41236	205 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	KIF22	Q14807	665 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	TCHP	Q9BT92	498 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		7.52	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC66	A2RUB6	948 aa		7.52	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		7.52	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	BRF1	Q92994	677 aa		7.52	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	AOX1	Q06278	1338 aa		7.52	□□□□□ -1.2
ACACA-240	ENST00000617649	POTEB2	H3BUK9	544 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	EYA2	O00167	538 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	7.52	□□□□□ -1.21	5e-7	■■■■■ 30.4
ACACA-240	ENST00000617649	GPR162	Q16538	588 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	BACH1	O14867	736 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	RXRB	P28702	533 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	LMAN1	P49257	510 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	BRAP	Q7Z569	592 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	LPIN2	Q92539	896 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	RFX1	P22670	979 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	SMTN	P53814	917 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	MPND	Q8N594	471 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	CSAD	Q9Y600	493 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	PTPN14	Q15678	1187 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	DCAF15	Q66K64	600 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	KIF18A	Q8NI77	898 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	SPC25	Q9HBM1	224 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	ZBED4	O75132	1171 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	PPP2R5B	Q15173	497 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	ATL3	Q6DD88	541 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	CNKSR1	Q969H4	720 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	TMEM87B	Q96K49	555 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	MYOM2	P54296	1465 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	SLC8A3	P57103	927 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ACACA-240	ENST00000617649	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		7.51	□□□□□ -1.21

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