RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO33Q7Z6M2 555 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 TM6SF1Q9BZW5 370 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 ANTXR1Q9H6X2 564 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 PODXL2Q9NZ53 605 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 LRP2BPQ9P2M1 347 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 SRGNP10124 158 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 ADD2P35612 726 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 STYK1Q6J9G0 422 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 GYG1P46976 350 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 NEK4P51957 841 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 MSL1Q68DK7 614 aa27.05■■□□□ 1.92
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CAPNS1-212ENST00000591041 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
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CAPNS1-212ENST00000591041 GNAT2P19087 354 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 PTH1RQ03431 593 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 NECTIN1Q15223 517 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 CNKSR1Q969H4 720 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa27.04■■□□□ 1.92
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CAPNS1-212ENST00000591041 CHD4Q14839 1912 aa27.04■■□□□ 1.92
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CAPNS1-212ENST00000591041 CREB3L3Q68CJ9 461 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 IL25Q9H293 177 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 SNX14Q9Y5W7 946 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 UFL1O94874 794 aa27.02■■□□□ 1.92
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CAPNS1-212ENST00000591041 AIDAQ96BJ3 306 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 TAF1P21675 1872 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 TSGA10IPQ3SY00 556 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 PI16Q6UXB8 463 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 EYA3Q99504 573 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 SNAP23O00161 211 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC27A2O14975 620 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 GPSM2P81274 684 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD1Q15327 319 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 RAI14Q9P0K7 980 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 DUOX1Q9NRD9 1551 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF532Q9HCE3 1301 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCF2Q9UG63 623 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
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CAPNS1-212ENST00000591041 MAGEB6Q8N7X4 407 aa26.98■■□□□ 1.91
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CAPNS1-212ENST00000591041 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 NACAP1Q9BZK3 213 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 PALD1Q9ULE6 856 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 C6orf229H3BNL8 230 aa26.97■■□□□ 1.91
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CAPNS1-212ENST00000591041 GSTO1P78417 241 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 MPNDQ8N594 471 aa26.97■■□□□ 1.91
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CAPNS1-212ENST00000591041 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
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CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 COL4A1P02462 1669 aa26.96■■□□□ 1.91
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CAPNS1-212ENST00000591041 M0R2C6 588 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 POLD1P28340 1107 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR162Q16538 588 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 CERS3Q8IU89 383 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 SALL1Q9NSC2 1324 aa26.95■■□□□ 1.91
CAPNS1-212ENST00000591041 G3V3G9 751 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 CASTP20810 708 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 C1QTNF8P60827 252 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 VPS53Q5VIR6 699 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
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CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 SLF2Q8IX21 1173 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 KLHL34Q8N239 644 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 APPP05067 770 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP7A1P22680 504 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 RUFY3Q7L099 469 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-212ENST00000591041 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
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