RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC51AQ86UW1 340 aa37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 C7orf43Q8WVR3 580 aa37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ANO2Q9NQ90 1003 aa37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0D9SFI3 127 aa37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 WASHC4Q2M389 1173 aa37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 EYA3Q99504 573 aa37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 MAST2Q6P0Q8 1798 aa37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 DPEP1P16444 411 aa37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNA3P22001 575 aa37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP3K12Q12852 859 aa37.39■■■■□ 3.58
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CAPNS1-206ENST00000588815 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
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CAPNS1-206ENST00000588815 IL25Q9H293 177 aa37.38■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE3CQ15386 1083 aa37.37■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 IL1R1P14778 569 aa37.36■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
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CAPNS1-206ENST00000588815 CHD4Q14839 1912 aa37.35■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0G2JLW4 131 aa37.35■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 IDH1O75874 414 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
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CAPNS1-206ENST00000588815 ADD2P35612 726 aa37.35■■■■□ 3.57
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
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CAPNS1-206ENST00000588815 CD209Q9NNX6 404 aa37.34■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 PIM2Q9P1W9 311 aa37.34■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SALL1Q9NSC2 1324 aa37.34■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SOGA3Q5TF21 947 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SUPT20HQ8NEM7 779 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR66Q8TBY9 1149 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 COA1Q9GZY4 146 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SPON1Q9HCB6 807 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 LRP2BPQ9P2M1 347 aa37.33■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC171Q6TFL3 1326 aa37.32■■■■□ 3.57
CAPNS1-206ENST00000588815 OLFM4Q6UX06 510 aa37.32■■■■□ 3.56
CAPNS1-206ENST00000588815 PDE6AP16499 860 aa37.3■■■■□ 3.56
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC93Q567U6 631 aa37.3■■■■□ 3.56
CAPNS1-206ENST00000588815 RTKN2Q8IZC4 609 aa37.3■■■■□ 3.56
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
CAPNS1-206ENST00000588815 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
CAPNS1-206ENST00000588815 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa37.28■■■■□ 3.56
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCF2Q9UG63 623 aa37.27■■■■□ 3.56
CAPNS1-206ENST00000588815 MAST3O60307 1309 aa37.27■■■■□ 3.56
CAPNS1-206ENST00000588815 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa37.27■■■■□ 3.56
CAPNS1-206ENST00000588815 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa37.26■■■■□ 3.56
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CAPNS1-206ENST00000588815 MAP4K1Q92918 833 aa37.26■■■■□ 3.56
CAPNS1-206ENST00000588815 OSBP2Q969R2 916 aa37.26■■■■□ 3.56
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF532Q9HCE3 1301 aa37.26■■■■□ 3.55
CAPNS1-206ENST00000588815 CHGBP05060 677 aa37.25■■■■□ 3.55
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CAPNS1-206ENST00000588815 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
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CAPNS1-206ENST00000588815 DDRGK1Q96HY6 314 aa37.25■■■■□ 3.55
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CAPNS1-206ENST00000588815 FAM205AQ6ZU69 1335 aa37.24■■■■□ 3.55
CAPNS1-206ENST00000588815 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
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CAPNS1-206ENST00000588815 PSME4Q14997 1843 aa37.24■■■■□ 3.55
CAPNS1-206ENST00000588815 RIMBP2O15034 1052 aa37.23■■■■□ 3.55
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CAPNS1-206ENST00000588815 DSCC1Q9BVC3 393 aa37.23■■■■□ 3.55
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS33BQ9H267 617 aa37.23■■■■□ 3.55
CAPNS1-206ENST00000588815 RAI14Q9P0K7 980 aa37.23■■■■□ 3.55
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PTH1RQ03431 593 aa37.22■■■■□ 3.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PODNQ7Z5L7 613 aa37.22■■■■□ 3.55
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
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CAPNS1-206ENST00000588815 IL27Q8NEV9 243 aa37.21■■■■□ 3.55
CAPNS1-206ENST00000588815 G3V3G9 751 aa37.2■■■■□ 3.55
CAPNS1-206ENST00000588815 M0R2C6 588 aa37.2■■■■□ 3.55
CAPNS1-206ENST00000588815 DCAF8Q5TAQ9 597 aa37.2■■■■□ 3.55
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CAPNS1-206ENST00000588815 KIF2CQ99661 725 aa37.19■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 GPAA1O43292 621 aa37.18■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
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CAPNS1-206ENST00000588815 RNF20Q5VTR2 975 aa37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-206ENST00000588815 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
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