RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 SHTN1A0MZ66 631 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 CERS5Q8N5B7 392 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 EPHX2P34913 555 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 GORABQ5T7V8 394 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 MICALL2Q8IY33 904 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 SCN4AP35499 1836 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 AACSQ86V21 672 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-208ENST00000566059 ZBTB22O15209 634 aa22.02■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.02■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 SEMA3EO15041 775 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 RASGRF1Q13972 1273 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 H7C1D1 291 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 USP17L8P0C7I0 530 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 MFSD14BQ5SR56 506 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 BCL11AQ9H165 835 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 IGHDP01880 384 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 POTEIP0CG38 1075 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 POTEJP0CG39 1038 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 EGFRP00533 1210 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 SCARF1Q14162 830 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 GRIK5Q16478 980 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 TOMM70O94826 608 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 OGFOD1Q8N543 542 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 GCC1Q96CN9 775 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 F8W031 263 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 MCAMP43121 646 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 PI16Q6UXB8 463 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-208ENST00000566059 SPATA5Q8NB90 893 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 MMP14P50281 582 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 LDHDQ86WU2 507 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 SMC5Q8IY18 1101 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 SNRKQ9NRH2 765 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 PRDX5P30044 214 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 CHADLQ6NUI6 762 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 ABCF2Q9UG63 623 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 ZAP70P43403 619 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-208ENST00000566059 WNT10BO00744 389 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-208ENST00000566059 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
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