RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555658.5

FOXN3-210, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 3

Gene FOXN3, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-210ENST00000555658 IRAK1P51617 712 aa6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 MCTP1Q6DN14 999 aa6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 ATCAYQ86WG3 371 aa6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 HELQQ8TDG4 1101 aa6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 MYRFLQ96LU7 910 aa6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 ADAM19Q9H013 955 aa6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 RNF208Q9H0X6 261 aa6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 SEPT3Q9UH03 358 aa6.41□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 RNF43Q68DV7 783 aa6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 ZMYND15Q9H091 742 aa6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.4□□□□□ -1.38
FOXN3-210ENST00000555658 WDR97A6NE52 1622 aa6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 KIF21BO75037 1637 aa6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 HMX2A2RU54 273 aa6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 TGFB1P01137 390 aa6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 BMP3P12645 472 aa6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 NLRP12P59046 1061 aa6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 XKR5Q6UX68 686 aa6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 MTMR7Q9Y216 660 aa6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.39□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.38□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 BEND4Q6ZU67 534 aa6.38□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 CNTN3Q9P232 1028 aa6.38□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.38□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.38□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.37□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 CEP162Q5TB80 1403 aa6.37□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.37□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 PHACTR2O75167 634 aa6.37□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 PDGFAP04085 211 aa6.37□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 EDN3P14138 238 aa6.37□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 RXRBP28702 533 aa6.37□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 IKBKEQ14164 716 aa6.37□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.37□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.37□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 SYNJ2O15056 1496 aa6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 CLIP1P30622 1438 aa6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 ADAM11O75078 769 aa6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 TXKP42681 527 aa6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 USP5P45974 858 aa6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 EHHADHQ08426 723 aa6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 BSNDQ8WZ55 320 aa6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 OSMRQ99650 979 aa6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 ATG3Q9NT62 314 aa6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 CUL7Q14999 1698 aa6.36□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 MPSTP25325 297 aa6.35□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 PREPP48147 710 aa6.35□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.35□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 USP26Q9BXU7 913 aa6.35□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.35□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.35□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 FAM13AO94988 1023 aa6.34□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 WNT11O96014 354 aa6.34□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 ACPPP15309 386 aa6.34□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.34□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.34□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.34□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 SOX13Q9UN79 622 aa6.34□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 POLIQ9UNA4 740 aa6.34□□□□□ -1.39
FOXN3-210ENST00000555658 GRIN2AQ12879 1464 aa6.34□□□□□ -1.4
FOXN3-210ENST00000555658 MEGF11A6BM72 1044 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms