RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 MED23Q9ULK4 1368 aa17.74■□□□□ 0.43
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CS-231ENST00000552222 DPF3Q92784 378 aa17.73■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
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CS-231ENST00000552222 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
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CS-231ENST00000552222 HYPKQ9NX55 129 aa17.69■□□□□ 0.42
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CS-231ENST00000552222 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 CFAP100Q494V2 611 aa17.68■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 PRO3102Q9H379 93 aa17.68■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 GNAI1P63096 354 aa17.67■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 GOLGA2Q08379 1002 aa17.67■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 RASA3Q14644 834 aa17.67■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa17.67■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 NBPF11Q86T75 865 aa17.67■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 A0A0C4DFX4 3053 aa17.67■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 OTOFQ9HC10 1997 aa17.66■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa17.66■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 CCL15Q16663 113 aa17.66■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 CCDC191Q8NCU4 936 aa17.66■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 CD209Q9NNX6 404 aa17.66■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 ZNF804BA4D1E1 1349 aa17.66■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 TAF5LO75529 589 aa17.65■□□□□ 0.42
CS-231ENST00000552222 IGKV5-2P06315 115 aa17.65■□□□□ 0.42
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CS-231ENST00000552222 SPDYE6P0CI01 402 aa17.64■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa17.64■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP17.63■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.63■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 VGLL4Q14135 290 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa17.63■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 LEMD3Q9Y2U8 911 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 IRS2Q9Y4H2 1338 aa17.62■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 Q7L0L9 218 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 TEPSINQ96N21 525 aa17.61■□□□□ 0.41
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CS-231ENST00000552222 LAMA3Q16787 3333 aa17.6■□□□□ 0.41
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CS-231ENST00000552222 BTBD19C9JJ37 291 aa17.6■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 HOXB7P09629 217 aa17.6■□□□□ 0.41
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CS-231ENST00000552222 CPA4Q9UI42 421 aa17.6■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa17.6■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 FANCIQ9NVI1 1328 aa17.59■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 ITGA6P23229 1130 aa17.59■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa17.59■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 MYH16Q9H6N6 1097 aa17.59■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
CS-231ENST00000552222 CCL5P13501 91 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-231ENST00000552222 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
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