RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527876.5

GNPTG-206, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 4

Gene GNPTG, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-206	ENST00000527876	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
GNPTG-206	ENST00000527876	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
GNPTG-206	ENST00000527876	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
GNPTG-206	ENST00000527876	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GNPTG-206	ENST00000527876	SUCLG2	Q96I99	432 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GNPTG-206	ENST00000527876	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GNPTG-206	ENST00000527876	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	HTT	P42858	3142 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	MAP3K11	Q16584	847 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	FZD1	Q9UP38	647 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	SPDYE6	P0CI01	402 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	DLGAP5	Q15398	846 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	NF2	P35240	595 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	CFAP100	Q494V2	611 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	UBE4A	Q14139	1066 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	JAG2	Q9Y219	1238 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GNPTG-206	ENST00000527876	PLIN1	O60240	522 aa		27.57	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	TBC1D8	O95759	1140 aa		27.57	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	PRKG1	Q13976	671 aa		27.57	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		27.57	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		27.57	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	CENPF	P49454	3210 aa		27.57	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876		F8W031	263 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	SPRYD7	Q5W111	196 aa		27.56	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		27.56	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		27.56	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	OTOF	Q9HC10	1997 aa		27.56	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	GYG1	P46976	350 aa		27.55	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		27.54	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		27.54	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	CLRN2	A0PK11	232 aa		27.53	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.53	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	LRRC24	Q50LG9	513 aa		27.52	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		27.52	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		27.52	■■■□□ 2
GNPTG-206	ENST00000527876	GPR25	O00155	361 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	GRIK5	Q16478	980 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	USP44	Q9H0E7	712 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	PTPRC	P08575	1304 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	UNCX	A6NJT0	531 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	SLFN5	Q08AF3	891 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	SREBF2	Q12772	1141 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	TEPSIN	Q96N21	525 aa		27.49	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	GJA5	P36382	358 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	RASA3	Q14644	834 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	BRCA2	P51587	3418 aa		27.48	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876		E9PSI1	815 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	MYO1B	O43795	1136 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	WNK4	Q96J92	1243 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	VEZT	Q9HBM0	779 aa		27.46	■■□□□ 1.99
GNPTG-206	ENST00000527876	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	27.45	■■□□□ 1.98
GNPTG-206	ENST00000527876	PDE8B	O95263	885 aa		27.45	■■□□□ 1.98
GNPTG-206	ENST00000527876	IFNL1	Q8IU54	200 aa		27.45	■■□□□ 1.98

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