RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.58■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 CREBZFQ9NS37 354 aa24.58■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.58■■□□□ 1.53
SMIM20-201ENST00000506197 PASKQ96RG2 1323 aa24.58■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 G3V3G9 751 aa24.57■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.57■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.57■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 GYG1P46976 350 aa24.56■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.56■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 MX1P20591 662 aa24.55■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 EPS15P42566 896 aa24.55■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.55■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.55■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 BCAMP50895 628 aa24.54■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 CXCL9Q07325 125 aa24.54■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC102BQ68D86 513 aa24.54■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 PDE4AP27815 886 aa24.53■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 PHKA1P46020 1223 aa24.53■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.53■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.53■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.52■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.52■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 CNTROBQ8N137 903 aa24.52■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 COA1Q9GZY4 146 aa24.52■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.52■■□□□ 1.52
SMIM20-201ENST00000506197 ERC2O15083 957 aa24.51■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 RAD17O75943 681 aa24.51■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.51■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.51■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 PDE1AP54750 535 aa24.5■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 DOK7Q18PE1 504 aa24.5■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.5■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.5■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.49■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 YDJCA8MPS7 323 aa24.49■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 TNIP1Q15025 636 aa24.49■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.49■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 CD209Q9NNX6 404 aa24.49■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 STAP2Q9UGK3 403 aa24.49■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 AOX1Q06278 1338 aa24.49■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.49■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 SEMA3EO15041 775 aa24.48■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 ECE2O60344 883 aa24.48■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 ATP5JP18859 108 aa24.48■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 RGS3P49796 1198 aa24.48■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 CNTNAP1P78357 1384 aa24.48■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 PSME4Q14997 1843 aa24.48■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.48■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 AK9Q5TCS8 1911 aa24.47■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 IL1R1P14778 569 aa24.47■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 PODNQ7Z5L7 613 aa24.47■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.47■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 SCN9AQ15858 1988 aa24.46■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 SKAP1Q86WV1 359 aa24.46■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.46■■□□□ 1.51
SMIM20-201ENST00000506197 RASGRF1Q13972 1273 aa24.45■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.45■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 MCAMP43121 646 aa24.44■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 IFFO2Q5TF58 517 aa24.44■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 SPATA5Q8NB90 893 aa24.44■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.44■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 FBXW7Q969H0 707 aa24.44■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 ZBTB22O15209 634 aa24.43■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 SCARF1Q14162 830 aa24.43■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.43■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 PSMD14O00487 310 aa24.42■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 HAUS7Q99871 368 aa24.42■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 SNRKQ9NRH2 765 aa24.42■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 MYH7P12883 1935 aa24.4■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 ZAP70P43403 619 aa24.4■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 GTF2IP78347 998 aa24.4■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 TTC22Q5TAA0 569 aa24.4■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 PI16Q6UXB8 463 aa24.4■■□□□ 1.5
SMIM20-201ENST00000506197 MICALL2Q8IY33 904 aa24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms