RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503586.1

PITX1-203, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 624 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-203ENST00000503586 TRAF5O00463 557 aa28.88■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 MMP14P50281 582 aa28.88■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 BCAMP50895 628 aa28.88■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 ATP8B2P98198 1209 aa28.88■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 CERS5Q8N5B7 392 aa28.88■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 COG6Q9Y2V7 657 aa28.88■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 SCARF1Q14162 830 aa28.87■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 FAM205AQ6ZU69 1335 aa28.87■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 USP48Q86UV5 1035 aa28.86■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 GGA3Q9NZ52 723 aa28.86■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.86■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 F8W031 263 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.85■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa28.85■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 TFCP2Q12800 502 aa28.84■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 POLA2Q14181 598 aa28.84■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 MFSD14BQ5SR56 506 aa28.84■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 SSH3Q8TE77 659 aa28.84■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.84■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
PITX1-203ENST00000503586 PDE3AQ14432 1141 aa28.82■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 NBPF9Q3BBW0 867 aa28.82■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 SULF1Q8IWU6 871 aa28.82■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 KLRG1Q96E93 195 aa28.82■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 ZNF408Q9H9D4 720 aa28.81■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 WNT10BO00744 389 aa28.8■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 CELF2O95319 508 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 TIMM10P62072 90 aa28.8■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 DLGAP5Q15398 846 aa28.8■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.8■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 CEP85Q6P2H3 762 aa28.8■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa28.8■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 ADM5C9JUS6 153 aa28.79■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 A0A1B0GUL7 405 aa28.78■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 CST9Q5W186 159 aa28.78■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa28.77■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 ADORA1P30542 326 aa28.77■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 DLK2Q6UY11 383 aa28.77■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.77■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.77■■■□□ 2.2
PITX1-203ENST00000503586 CFAP100Q494V2 611 aa28.76■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 TRPM7Q96QT4 1865 aa28.75■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 PHKA1P46020 1223 aa28.75■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 CCDC102BQ68D86 513 aa28.75■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 XAGE2Q96GT9 111 aa28.75■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 MTMR14Q8NCE2 650 aa28.74■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 WDR66Q8TBY9 1149 aa28.74■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 MYO1BO43795 1136 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 GORABQ5T7V8 394 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 DENND2AQ9ULE3 1009 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 CNTNAP1P78357 1384 aa28.73■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 SEMA3EO15041 775 aa28.72■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 GRIK5Q16478 980 aa28.72■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 DEFB115Q30KQ5 88 aa28.72■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 SERPINA10Q9UK55 444 aa28.72■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 ARAP2Q8WZ64 1704 aa28.72■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.71■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 SPDYE6P0CI01 402 aa28.71■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 CDCA5Q96FF9 252 aa28.71■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 TLL2Q9Y6L7 1015 aa28.71■■■□□ 2.19
PITX1-203ENST00000503586 RASSF10A6NK89 507 aa28.7■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 HMMRO75330 724 aa28.7■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa28.7■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 CRKP46108 304 aa28.69■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 GPR108Q9NPR9 543 aa28.69■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.69■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 MAST3O60307 1309 aa28.69■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 TNNI3KQ59H18 835 aa28.68■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 C2orf69Q8N8R5 385 aa28.68■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.68■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.68■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 CLRN2A0PK11 232 aa28.67■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
PITX1-203ENST00000503586 SAPCD2Q86UD0 394 aa28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms