RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500800.2

SMARCA5-AS1-201, SMARCA5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCA5-AS1, Length 945 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
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SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 HDAC9Q9UKV0 1011 aa28.01■■■□□ 2.07
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SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.9■■■□□ 2.06
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SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CYP4F22Q6NT55 531 aa27.83■■■□□ 2.05
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 CEP85Q6P2H3 762 aa27.83■■■□□ 2.05
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 COG6Q9Y2V7 657 aa27.83■■■□□ 2.05
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 HUNKP57058 714 aa27.82■■■□□ 2.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 XAGE2Q96GT9 111 aa27.82■■■□□ 2.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 MRIQ9BWK5 157 aa27.82■■■□□ 2.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
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SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PDE3AQ14432 1141 aa27.81■■■□□ 2.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 DENND2AQ9ULE3 1009 aa27.81■■■□□ 2.04
SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 AOX1Q06278 1338 aa27.81■■■□□ 2.04
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