RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, human

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKL1-208	ENST00000466278	PDE8B	O95263	885 aa		28.52	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	GYG1	P46976	350 aa		28.52	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		28.51	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	MAP2K2	P36507	400 aa		28.51	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		28.5	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		28.5	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	JAG2	Q9Y219	1238 aa		28.5	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	EYA2	O00167	538 aa		28.49	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	VPS37D	Q86XT2	251 aa		28.49	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	MEIS3	Q99687	375 aa		28.49	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	AOC2	O75106	756 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	TRIM27	P14373	513 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	DLGAP5	Q15398	846 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278		F8W031	263 aa	Predicted RBP	28.47	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	BCAR3	O75815	825 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	FKBP1B	P68106	108 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	RGMB	Q6NW40	437 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	28.47	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	FBXO3	Q9UK99	471 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		28.46	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	GNAI3	P08754	354 aa		28.46	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	NOG	Q13253	232 aa		28.46	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		28.46	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
MKL1-208	ENST00000466278	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		28.45	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	CIAO1	O76071	339 aa		28.44	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	FGFR2	P21802	821 aa		28.44	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	CFAP100	Q494V2	611 aa		28.44	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	NF2	P35240	595 aa		28.43	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		28.43	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	CCDC102A	Q96A19	550 aa		28.43	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	SIL1	Q9H173	461 aa		28.43	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		28.42	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	MYO1B	O43795	1136 aa		28.42	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	SPDYE6	P0CI01	402 aa		28.42	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	SLC5A1	P13866	664 aa		28.42	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	TNS4	Q8IZW8	715 aa		28.42	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		28.41	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		28.41	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		28.41	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	LPIN2	Q92539	896 aa		28.41	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	LBX1	P52954	281 aa		28.4	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		28.4	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	28.4	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	TNN	Q9UQP3	1299 aa		28.4	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	CA12	O43570	354 aa		28.39	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	SLC10A3	P09131	477 aa		28.39	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	BCAM	P50895	628 aa		28.39	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	28.39	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		28.39	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	COPRS	Q9NQ92	184 aa		28.39	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		28.39	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		28.39	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		28.39	■■■□□ 2.14
MKL1-208	ENST00000466278	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		28.38	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	MTX1	Q13505	466 aa		28.37	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	CLRN2	A0PK11	232 aa		28.36	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	SRGAP3	O43295	1099 aa		28.36	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	ATP2B3	Q16720	1220 aa		28.36	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	ZIC5	Q96T25	663 aa		28.36	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		28.36	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	GNAI2	P04899	355 aa		28.35	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	MOB2	Q70IA6	237 aa		28.35	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		28.35	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	VEZT	Q9HBM0	779 aa		28.35	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		28.34	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	CRK	P46108	304 aa		28.33	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	AOX1	Q06278	1338 aa		28.33	■■■□□ 2.13
MKL1-208	ENST00000466278	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		28.32	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		28.32	■■■□□ 2.12
MKL1-208	ENST00000466278	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		28.32	■■■□□ 2.12

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