RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 USP48Q86UV5 1035 aa25.43■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 SULF1Q8IWU6 871 aa25.43■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 LPIN2Q92539 896 aa25.43■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 KLRG1Q96E93 195 aa25.43■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 GGA3Q9NZ52 723 aa25.43■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.43■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.43■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 MTX1Q13505 466 aa25.42■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.42■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.41■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.4■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.4■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 BCAMP50895 628 aa25.39■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.667e-7■■■□□ 14.8
SCAF8-204ENST00000461219 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.39■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SCAF8-204ENST00000461219 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.38■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 FGFR2P21802 821 aa25.38■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 DLGAP5Q15398 846 aa25.38■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.38■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.37■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 CERS5Q8N5B7 392 aa25.37■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.37■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 ADM5C9JUS6 153 aa25.36■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 MYO1BO43795 1136 aa25.36■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.36■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.36■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 COG6Q9Y2V7 657 aa25.36■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 ATP8B2P98198 1209 aa25.35■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 TFCP2Q12800 502 aa25.35■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.35■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 WNT10BO00744 389 aa25.34■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 GORABQ5T7V8 394 aa25.34■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.34■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.34■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 CNTNAP1P78357 1384 aa25.33■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 CFAP100Q494V2 611 aa25.33■■□□□ 1.65
SCAF8-204ENST00000461219 GRM1Q13255 1194 aa25.32■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 CST9Q5W186 159 aa25.32■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 A0A1B0GUL7 405 aa25.31■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 TIMM10P62072 90 aa25.31■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.31■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.31■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 POLA2Q14181 598 aa25.3■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 SSH3Q8TE77 659 aa25.3■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 CDCA5Q96FF9 252 aa25.3■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 MAST3O60307 1309 aa25.3■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 NF2P35240 595 aa25.29■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 ECE1P42892 770 aa25.29■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 DLK2Q6UY11 383 aa25.29■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.29■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.29■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 RASSF10A6NK89 507 aa25.28■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 ADORA1P30542 326 aa25.28■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 PDE3AQ14432 1141 aa25.28■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 CEP85Q6P2H3 762 aa25.28■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.28■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 XAGE2Q96GT9 111 aa25.28■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 VEZTQ9HBM0 779 aa25.28■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.28■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 SEMA3EO15041 775 aa25.27■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 PHKA1P46020 1223 aa25.27■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC102BQ68D86 513 aa25.27■■□□□ 1.64
SCAF8-204ENST00000461219 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.26■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 HMMRO75330 724 aa25.26■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 SPDYE6P0CI01 402 aa25.26■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 VEGFBP49765 207 aa25.26■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 JMYQ8N9B5 988 aa25.26■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 TEKT1Q969V4 418 aa25.26■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.26■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 CLRN2A0PK11 232 aa25.25■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 CRKP46108 304 aa25.25■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 HUNKP57058 714 aa25.25■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.25■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.25■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SCAF8-204ENST00000461219 CAPNS2Q96L46 248 aa25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.1 ms