RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	TECPR2	O15040	1411 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	ST5	P78524	1137 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	GCKR	Q14397	625 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	PDILT	Q8N807	584 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	GSDMD	P57764	484 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	IQCB1	Q15051	598 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	PACS2	Q86VP3	889 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNB2	Q92953	911 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	DNAI1	Q9UI46	699 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	UBXN4	Q92575	508 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP5J	P18859	108 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	CLCN6	P51797	869 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	TBX22	Q9Y458	520 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	NDUFA8	P51970	172 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	GPS2	Q13227	327 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	PFKFB2	O60825	505 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	GC	P02774	474 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	CDC25B	P30305	580 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF790	Q6PG37	636 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157		A0A0G2JLW4	131 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	DEF6	Q9H4E7	631 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	PTPRU	Q92729	1446 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	MED23	Q9ULK4	1368 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157		E7EWF7	191 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	SPTLC2	O15270	562 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	MAGEA9	P43362	315 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	CLIC4	Q9Y696	253 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	CCZ1B	P86790	482 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	TRDN	Q13061	729 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	SARM1	Q6SZW1	724 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.31
SSUH2-208	ENST00000455157	AKAP12	Q02952	1782 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSUH2-208	ENST00000455157	RXRA	P19793	462 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSUH2-208	ENST00000455157	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SSUH2-208	ENST00000455157	MED4	Q9NPJ6	270 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSUH2-208	ENST00000455157	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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