RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 CERS5Q8N5B7 392 aa22.34■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.34■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.34■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.34■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.33■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 HTRA3P83110 453 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.31■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 A0A1B0GUL7 405 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 F8W031 263 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 ADORA1P30542 326 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 MMP14P50281 582 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 TIMM10P62072 90 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 SCARF1Q14162 830 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 TRAF5O00463 557 aa22.29■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.29■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 GGA3Q9NZ52 723 aa22.28■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 PHKA1P46020 1223 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 USP48Q86UV5 1035 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 XAGE2Q96GT9 111 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HERC3-205ENST00000426683 WNT10BO00744 389 aa22.26■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 CCDC102BQ68D86 513 aa22.26■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.26■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.26■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 CREBZFQ9NS37 354 aa22.26■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.25■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 ADM5C9JUS6 153 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 HMMRO75330 724 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 DLGAP5Q15398 846 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 SULF1Q8IWU6 871 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 SEMA3EO15041 775 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 GRIK5Q16478 980 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 CFAP100Q494V2 611 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 TNNI3KQ59H18 835 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 DLK2Q6UY11 383 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 GPR108Q9NPR9 543 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 GORABQ5T7V8 394 aa22.22■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.22■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.22■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.22■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 CST9Q5W186 159 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-205ENST00000426683 ZBTB22O15209 634 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 RASGRF1Q13972 1273 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.19■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 SPDYE6P0CI01 402 aa22.19■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 CRKP46108 304 aa22.19■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.19■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 KLRG1Q96E93 195 aa22.18■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 MAST3O60307 1309 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 MYO1BO43795 1136 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 CDCA5Q96FF9 252 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 CRBNQ96SW2 442 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 AOX1Q06278 1338 aa22.16■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 CLRN2A0PK11 232 aa22.16■■□□□ 1.14
HERC3-205ENST00000426683 APBB1O00213 710 aa22.16■■□□□ 1.14
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