RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.71■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.7■■□□□ 1.71
UBE2E3-201ENST00000392415 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 FGFR2P21802 821 aa25.69■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.69■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 CIAO1O76071 339 aa25.68■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 JAG2Q9Y219 1238 aa25.68■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 ECE1P42892 770 aa25.67■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.67■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 VPS37DQ86XT2 251 aa25.67■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 CAPNS2Q96L46 248 aa25.67■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 SIL1Q9H173 461 aa25.67■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 COPRSQ9NQ92 184 aa25.67■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 MTX1Q13505 466 aa25.66■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.66■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.66■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.66■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 CDCA5Q96FF9 252 aa25.66■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 LPIN2Q92539 896 aa25.65■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 GNAI2P04899 355 aa25.64■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.64■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.64■■□□□ 1.7
UBE2E3-201ENST00000392415 F8W031 263 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 BCAMP50895 628 aa25.63■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 HUNKP57058 714 aa25.63■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 DLGAP5Q15398 846 aa25.63■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.63■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.63■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.63■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 SRGAP3O43295 1099 aa25.63■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC5A1P13866 664 aa25.63■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.62■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 WBP1LQ9NX94 342 aa25.62■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 GRM1Q13255 1194 aa25.61■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 CFAP100Q494V2 611 aa25.61■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP2K2P36507 400 aa25.6■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP2B3Q16720 1220 aa25.6■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.6■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
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UBE2E3-201ENST00000392415 SPDYE6P0CI01 402 aa25.59■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 RLBP1P12271 317 aa25.59■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 FKBP1BP68106 108 aa25.59■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.59■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 AOC2O75106 756 aa25.58■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.58■■□□□ 1.69
UBE2E3-201ENST00000392415 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.58■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXN1O15353 648 aa25.57■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 MYO1BO43795 1136 aa25.57■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 RGMBQ6NW40 437 aa25.57■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 AIDAQ96BJ3 306 aa25.57■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.56■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.56■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 GRIK5Q16478 980 aa25.56■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.55■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 NOGQ13253 232 aa25.54■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.54■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.54■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 AOX1Q06278 1338 aa25.54■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 CLRN2A0PK11 232 aa25.53■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 NF2P35240 595 aa25.53■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 CRKP46108 304 aa25.53■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.53■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC102AQ96A19 550 aa25.53■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB22O15209 634 aa25.52■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 TFCP2Q12800 502 aa25.52■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 MRIQ9BWK5 157 aa25.52■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.52■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.52■■□□□ 1.68
UBE2E3-201ENST00000392415 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 TIMM10P62072 90 aa25.51■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP8B2P98198 1209 aa25.51■■□□□ 1.67
UBE2E3-201ENST00000392415 POLA2Q14181 598 aa25.51■■□□□ 1.67
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