RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381223.9

ZBED1-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED1, Length 4,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-203ENST00000381223 DHX58Q96C10 678 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 PTCH1Q13635 1447 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 ALKQ9UM73 1620 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 PDE4BQ07343 736 aa16.73■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 KCNQ4P56696 695 aa16.72■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 TCIRG1Q13488 830 aa16.72■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 MCM9Q9NXL9 1143 aa16.72■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 CEP152O94986 1710 aa16.72■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 UBA7P41226 1012 aa16.72■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 PLIN2Q99541 437 aa16.72■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa16.72■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 A0A087WWV3 80 aa16.71■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 TTC6Q86TZ1 520 aa16.71■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 IFNKQ9P0W0 207 aa16.71■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 CFAP74Q9C0B2 1584 aa16.71■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 ZNF532Q9HCE3 1301 aa16.71■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 ADGRB3O60242 1522 aa16.71■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.71■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 PI4K2BQ8TCG2 481 aa16.71■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa16.71■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 LRRC7Q96NW7 1537 aa16.71■□□□□ 0.27
ZBED1-203ENST00000381223 PICALMQ13492 652 aa16.71■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 TSC1Q92574 1164 aa16.7■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 CYP21A2P08686 494 aa16.7■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 CABP5Q9NP86 173 aa16.7■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 ADD1P35611 737 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 CEP135Q66GS9 1140 aa16.7■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 MAP4K1Q92918 833 aa16.7■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 TM6SF1Q9BZW5 370 aa16.7■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 CNNM2Q9H8M5 875 aa16.7■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 ZNF76P36508 570 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 ARAP3Q8WWN8 1544 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 RUFY1Q96T51 708 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 CBX8Q9HC52 389 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 ERICH4A6NGS2 130 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 GNPATO15228 680 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 NR1I2O75469 434 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 PDE8AO60658 829 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 IGKV5-2P06315 115 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 TSPY3P0CV98 308 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 TSPY8P0CW00 308 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 KIAA1328Q86T90 577 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 KIF2CQ99661 725 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 GREM2Q9H772 168 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 COPRSQ9NQ92 184 aa16.69■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 CYP27B1O15528 508 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 GTF3C6Q969F1 213 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 ZNF287Q9HBT7 754 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 KCNJ14Q9UNX9 436 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 BAG3O95817 575 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 FGAP02671 866 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 FAM193AP78312 1265 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 USP28Q96RU2 1077 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 GNG11P61952 73 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 QRICH2Q9H0J4 1663 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 KIF5BP33176 963 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 DNAI1Q9UI46 699 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 N4BP3O15049 544 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 GSDMDP57764 484 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 FAM160A1Q05DH4 1040 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 SNAP23O00161 211 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 CAVIN2O95810 425 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.262e-6■■□□□ 14.2
ZBED1-203ENST00000381223 HAUS7Q99871 368 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 FSD2A1L4K1 749 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 TRIM75PA6NK02 468 aa16.67■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 MCM7P33993 719 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 TPTE2Q6XPS3 522 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 ZSCAN12O43309 604 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 SYNE4Q8N205 404 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 TMTC2Q8N394 836 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 RIMBP2O15034 1052 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 ZNF174Q15697 407 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 RRAGBQ5VZM2 374 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 STAMQ92783 540 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 V9GY48 417 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 POLA2Q14181 598 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED1-203ENST00000381223 BCAMP50895 628 aa16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms