RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364043.1

SNORD46-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 46, humanhuman

BASIC

Gene SNORD46, Length 104 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD46-201ENST00000364043 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 TRIM47Q96LD4 638 aa9.96□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.96□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 SRRDQ9UH36 339 aa9.96□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.96□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 PSME4Q14997 1843 aa9.96□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 G3V3G9 751 aa9.95□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 WNT10BO00744 389 aa9.95□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 HOXD10P28358 340 aa9.95□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 GPSM2P81274 684 aa9.95□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.95□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.95□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 RAET1EQ8TD07 263 aa9.95□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 LAMB2P55268 1798 aa9.94□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 E9PSI1 815 aa9.94□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 TLR2O60603 784 aa9.94□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 MMP14P50281 582 aa9.94□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 CCDC27Q2M243 656 aa9.94□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.94□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.94□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.94□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.94□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 RUNDC1Q96C34 613 aa9.94□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.94□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.94□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa9.93□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 APAF1O14727 1248 aa9.93□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 CTGFP29279 349 aa9.93□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 OGFOD1Q8N543 542 aa9.93□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.93□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.93□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.93□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 SASH1O94885 1247 aa9.92□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 FOSL2P15408 326 aa9.92□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.92□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.92□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 USP38Q8NB14 1042 aa9.92□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.92□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.92□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 CDH23Q9H251 3354 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 MYPNQ86TC9 1320 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 ADGRA2Q96PE1 1338 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 USP17L3A6NCW0 530 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 USP17L4A6NCW7 530 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 OSBPP22059 807 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 PSMC4P43686 418 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 GTF2A2P52657 109 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 CCL15Q16663 113 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 WDR63Q8IWG1 891 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 DEFB118Q96PH6 123 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 MXD3Q9BW11 206 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 DEFB129Q9H1M3 183 aa9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 MYO3BQ8WXR4 1341 aa9.9□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa9.9□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 WWC1Q8IX03 1113 aa9.9□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.9□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 OPTNQ96CV9 577 aa9.9□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 ELP3Q9H9T3 547 aa9.9□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.9□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SNORD46-201ENST00000364043 PODNQ7Z5L7 613 aa9.89□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.89□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.89□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.88□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 UFL1O94874 794 aa9.88□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 MYL6BP14649 208 aa9.88□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 NBPF3Q9H094 633 aa9.88□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 MRE11P49959 708 aa9.87□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 PRKCZQ05513 592 aa9.87□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 C17orf99Q6UX52 265 aa9.87□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF428Q96B54 188 aa9.87□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 CPA4Q9UI42 421 aa9.87□□□□□ -0.83
SNORD46-201ENST00000364043 GGA1Q9UJY5 639 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms