RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POU2F2P09086 479 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SDHBP21912 280 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MOGSQ13724 837 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C4orf46Q504U0 113 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IER5Q5VY09 327 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF547Q8IVP9 402 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q96M66 194 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HERPUD2Q9BSE4 406 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF39Q9H2S5 420 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RETNQ9HD89 108 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ESM1Q9NQ30 184 aa-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP-2.18□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A087WYN8 130 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPRY2O43597 315 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 B4GALT2O60909 372 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TJP3O95049 919 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 P0C880 135 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TYRP1P17643 537 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AMY2BP19961 511 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HOXC13P31276 330 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LAMB3Q13751 1172 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDSNQ15517 529 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRADDQ15628 312 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBXL22Q6P050 247 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLNKQ7Z7G1 428 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCUBE1Q8IWY4 988 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SUV39H2Q9H5I1 410 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MDFICQ9P1T7 246 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WASF3Q9UPY6 502 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FRYLO94915 3013 aa-2.19□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABLIM3O94929 683 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DEFA1P59665 94 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NBPF9Q3BBW0 867 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C6orf118Q5T5N4 469 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SOGA3Q5TF21 947 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRR14Q9BWN1 585 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WNT8AQ9H1J5 351 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 YY1AP1Q9H869 796 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM39AQ9NV64 488 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLCL2Q9UPR0 1127 aa-2.2□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF185O15231 689 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CALCAP01258 141 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF688P0C7X2 276 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MT1GP13640 62 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EN2P19622 333 aaPredicted RBP-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCSK6P29122 969 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DEFA3P59666 94 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP12-1P59990 96 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MT1XP80297 61 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZXDBP98169 803 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACAP1Q15027 740 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLK5Q496M5 336 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRTC3Q6UUV7 619 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRP11Q86VZ4 500 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CERKQ8TCT0 537 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GLG1Q92896 1179 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IKZF3Q9UKT9 509 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NTNG1Q9Y2I2 539 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLX4Q8IY92 1834 aa-2.21□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SYNJ1O43426 1573 aa-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VWDEQ8N2E2 1590 aa-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GLTPD2A6NH11 291 aa-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TBKBP1A7MCY6 615 aa-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD96P40200 585 aa-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q6ZNB5 142 aa-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C5orf24Q7Z6I8 188 aa-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TPRX1Q8N7U7 411 aa-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 B3GNT4Q9C0J1 378 aa-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WASH6PQ9NQA3 447 aa-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WBP1LQ9NX94 342 aa-2.22□□□□□ -2.76
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP-2.22□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms