RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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ANKRD40-201ENST00000285243 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.05■■□□□ 1.12
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ANKRD40-201ENST00000285243 ST5P78524 1137 aa22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40-201ENST00000285243 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.04■■□□□ 1.12
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ANKRD40-201ENST00000285243 STAP2Q9UGK3 403 aa22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40-201ENST00000285243 RPS6KB1P23443 525 aa22.04■■□□□ 1.12
ANKRD40-201ENST00000285243 CUL4AQ13619 759 aa22.04■■□□□ 1.12
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ANKRD40-201ENST00000285243 E9PCH4 1651 aa22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40-201ENST00000285243 SSH2Q76I76 1423 aa22.03■■□□□ 1.12
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ANKRD40-201ENST00000285243 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40-201ENST00000285243 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40-201ENST00000285243 TSC1Q92574 1164 aa22.03■■□□□ 1.12
ANKRD40-201ENST00000285243 DNA2P51530 1060 aa22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40-201ENST00000285243 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40-201ENST00000285243 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
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ANKRD40-201ENST00000285243 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.02■■□□□ 1.12
ANKRD40-201ENST00000285243 FEZ1Q99689 392 aa22.02■■□□□ 1.12
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ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.02■■□□□ 1.11
ANKRD40-201ENST00000285243 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.01■■□□□ 1.11
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ANKRD40-201ENST00000285243 ZSCAN12O43309 604 aa22.01■■□□□ 1.11
ANKRD40-201ENST00000285243 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.01■■□□□ 1.11
ANKRD40-201ENST00000285243 ATP7BP35670 1465 aa22.01■■□□□ 1.11
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ANKRD40-201ENST00000285243 CBX8Q9HC52 389 aa21.99■■□□□ 1.11
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ANKRD40-201ENST00000285243 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.98■■□□□ 1.11
ANKRD40-201ENST00000285243 SPTLC2O15270 562 aa21.98■■□□□ 1.11
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ANKRD40-201ENST00000285243 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.96■■□□□ 1.11
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ANKRD40-201ENST00000285243 UFL1O94874 794 aa21.95■■□□□ 1.11
ANKRD40-201ENST00000285243 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.95■■□□□ 1.11
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ANKRD40-201ENST00000285243 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.95■■□□□ 1.11
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