RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP32.73■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 TCIRG1Q13488 830 aa32.73■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 NRBP1Q9UHY1 535 aa32.73■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 ME1P48163 572 aa32.73■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 TTLL5Q6EMB2 1281 aa32.73■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 ANO10Q9NW15 660 aa32.73■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 RTEL1Q9NZ71 1219 aa32.73■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP32.72■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 ZNF710Q8N1W2 664 aa32.72■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 XAGE2Q96GT9 111 aa32.72■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 TMOD3Q9NYL9 352 aa32.72■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 FDPSP14324 419 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 CHST3Q7LGC8 479 aa32.71■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 FSIP1Q8NA03 581 aa32.71■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 PLA2G12BQ9BX93 195 aa32.71■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 LRMPQ12912 555 aa32.71■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 MYH7P12883 1935 aa32.7■■■□□ 2.83
UBP1-201ENST00000283628 WDR19Q8NEZ3 1342 aa32.7■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 A0A1W2PQ27 194 aa32.7■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 A0A1W2PQ64 194 aa32.7■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 A0A1W2PQD8 194 aa32.7■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 NEMFO60524 1076 aa32.7■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 WASHC4Q2M389 1173 aa32.7■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 ADALQ6DHV7 355 aa32.7■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 APPBP2Q92624 585 aa32.7■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 WNK3Q9BYP7 1800 aa32.69■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 FOXP2O15409 715 aa32.69■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 RGS22Q8NE09 1264 aa32.68■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 PHLPP1O60346 1717 aa32.68■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 BECN2A8MW95 431 aa32.68■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 GUCY1B3Q02153 619 aa32.68■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 LRP6O75581 1613 aa32.67■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 ADORA1P30542 326 aa32.67■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 BCL2L12Q9HB09 334 aa32.67■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 ITGB4P16144 1822 aa32.67■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 PRC1O43663 620 aa32.66■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 FGAP02671 866 aa32.66■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 CEP57L1Q8IYX8 460 aa32.66■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 PCDHA7Q9UN72 937 aa32.66■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 CTIFO43310 598 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 CSF1RP07333 972 aa32.66■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 BRAPQ7Z569 592 aa32.66■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 NCOA7Q8NI08 942 aa32.66■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 KCNG4Q8TDN1 519 aa32.66■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 TSC1Q92574 1164 aa32.66■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 YEATS4O95619 227 aa32.65■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 C8orf76Q96K31 380 aa32.65■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 CCDC144BQ3MJ40 725 aa32.65■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 TAF7LQ5H9L4 462 aa32.65■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa32.65■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 PIGBQ92521 554 aa32.65■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 POLR3EQ9NVU0 708 aa32.65■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 LINC00301Q8NCQ3 95 aa32.64■■■□□ 2.82
UBP1-201ENST00000283628 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa32.63■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 KIF6Q6ZMV9 814 aa32.63■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa32.63■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA8BA8MQT2 603 aa32.63■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 HAND2P61296 217 aa32.63■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 LRRC8AQ8IWT6 810 aa32.63■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 HPS5Q9UPZ3 1129 aa32.63■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 ZAP70P43403 619 aa32.62■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP32.62■■■□□ 2.819e-7■■□□□ 14.1
UBP1-201ENST00000283628 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 SMTNL1A8MU46 457 aa32.62■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 SCARF1Q14162 830 aa32.62■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 NRAPQ86VF7 1730 aa32.61■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 ZNF213O14771 459 aa32.61■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 STK38Q15208 465 aa32.61■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP32.61■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa32.61■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 PPFIA3O75145 1194 aa32.6■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 ZMYND15Q9H091 742 aa32.6■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 ASAP1Q9ULH1 1129 aa32.6■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 RIC1Q4ADV7 1423 aa32.6■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 SDF4Q9BRK5 362 aa32.6■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 CDHR2Q9BYE9 1310 aa32.6■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 CPLX1O14810 134 aa32.59■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 GPAA1O43292 621 aa32.59■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 C4AP0C0L4 1744 aa32.59■■■□□ 2.81
UBP1-201ENST00000283628 C4BP0C0L5 1744 aa32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms