RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 MACROD2A1Z1Q3 448 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRE-201ENST00000254667 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRE-201ENST00000254667 PDE8AO60658 829 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRE-201ENST00000254667 DNA2P51530 1060 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRE-201ENST00000254667 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRE-201ENST00000254667 CERS3Q8IU89 383 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRE-201ENST00000254667 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRE-201ENST00000254667 APOBRQ0VD83 1088 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRE-201ENST00000254667 CNBD1Q8NA66 436 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRE-201ENST00000254667 PLVAPQ9BX97 442 aa21.59■■□□□ 1.05
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PTPRE-201ENST00000254667 TNNI3KQ59H18 835 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRE-201ENST00000254667 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRE-201ENST00000254667 ITGA6P23229 1130 aa21.58■■□□□ 1.04
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PTPRE-201ENST00000254667 G2E3Q7L622 706 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRE-201ENST00000254667 PLXNC1O60486 1568 aa21.58■■□□□ 1.04
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PTPRE-201ENST00000254667 VEZTQ9HBM0 779 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRE-201ENST00000254667 GOPCQ9HD26 462 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRE-201ENST00000254667 TUBB4AP04350 444 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRE-201ENST00000254667 SH2D4AQ9H788 454 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRE-201ENST00000254667 BICDL2A1A5D9 508 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRE-201ENST00000254667 MBD4O95243 580 aa21.56■■□□□ 1.04
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PTPRE-201ENST00000254667 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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PTPRE-201ENST00000254667 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.56■■□□□ 1.04
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PTPRE-201ENST00000254667 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
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PTPRE-201ENST00000254667 JADE2Q9NQC1 790 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRE-201ENST00000254667 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.54■■□□□ 1.04
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PTPRE-201ENST00000254667 PRPHP41219 470 aa21.54■■□□□ 1.04
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PTPRE-201ENST00000254667 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRE-201ENST00000254667 SPECC1Q5M775 1068 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRE-201ENST00000254667 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.53■■□□□ 1.04
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PTPRE-201ENST00000254667 CHST3Q7LGC8 479 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRE-201ENST00000254667 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.53■■□□□ 1.04
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PTPRE-201ENST00000254667 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.53■■□□□ 1.04
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PTPRE-201ENST00000254667 RPS6KB1P23443 525 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRE-201ENST00000254667 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRE-201ENST00000254667 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.52■■□□□ 1.03
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PTPRE-201ENST00000254667 DRC1Q96MC2 740 aa21.51■■□□□ 1.03
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PTPRE-201ENST00000254667 SAMD9Q5K651 1589 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 UFL1O94874 794 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 TMX1Q9H3N1 280 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRE-201ENST00000254667 LGR6Q9HBX8 967 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 LPIN2Q92539 896 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 GGA1Q9UJY5 639 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 KRT83P78385 493 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRE-201ENST00000254667 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.49■■□□□ 1.03
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