RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481849.5

HLA-B-253, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, human

Gene HLA-B, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HLA-B-253	ENST00000481849	RBP2	P50120	134 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	MTCP1	P56278	107 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	ZNF85	Q03923	595 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	ZNF91	Q05481	1191 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	RNF144B	Q7Z419	303 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849		Q8N2B8	174 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	EME1	Q96AY2	570 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	FGGY	Q96C11	551 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	SPACA5	Q96QH8	159 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	OR4F4	Q96R69	305 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	AP4S1	Q9Y587	144 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	ENTPD6	O75354	484 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	SULT1C4	O75897	302 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	IGLL1	P15814	213 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	ATF1	P18846	271 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	CDK2	P24941	298 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	HTR1D	P28221	377 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	OR3A1	P47881	315 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	P2RX3	P56373	397 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849		Q8IYB0	196 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	STMN2	Q93045	179 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	PHF21A	Q96BD5	680 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	NEK6	Q9HC98	313 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	GLS2	Q9UI32	602 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	DAPL1	A0PJW8	107 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	SH2D1B	O14796	132 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	MGST3	O14880	152 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	OR2H2	O95918	312 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	IGKV1D-12	P01611	117 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	ALDOB	P05062	364 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	PF4V1	P10720	104 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	ZNF44	P15621	663 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	PRKACB	P22694	351 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	GLIPR1	P48060	266 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	DYNLT3	P51808	116 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	LOXL3	P58215	753 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	CDC42	P60953	191 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	AES	Q08117	197 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	IL18R1	Q13478	541 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	PP6455	Q8WZ26	134 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	RFK	Q969G6	155 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	RNFT2	Q96EX2	444 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	OPALIN	Q96PE5	141 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	HMG20A	Q9NP66	347 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		7.18	□□□□□ -1.26
HLA-B-253	ENST00000481849	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		7.18	□□□□□ -1.26

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