RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 RPL15P61313 204 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 ZNF146Q15072 292 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 ZSCAN26Q16670 478 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 ZNF691Q5VV52 312 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 TMEM219Q86XT9 240 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 ZFP41Q8N8Y5 198 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.59□□□□□ -1.03
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NELFE-213ENST00000494956 Q96MT0 163 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 ZNF714Q96N38 554 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 C16orf95Q9H693 158 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 TAS2R4Q9NYW5 299 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-213ENST00000494956 DHDHQ9UQ10 334 aa8.59□□□□□ -1.03
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NELFE-213ENST00000494956 TMEM212A6NML5 194 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 HSPB6O14558 160 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 SULT1B1O43704 296 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 MT-ND2P03891 347 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ZNF44P15621 663 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 AESQ08117 197 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 DOC2BQ14184 412 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 CDK5R1Q15078 307 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 RCN1Q15293 331 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 KISS1Q15726 138 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 FAM189A2Q15884 450 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 SSX2Q16385 188 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 KLHL22Q53GT1 634 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ZNF626Q68DY1 528 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 Q6P435 159 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 SATL1Q86VE3 508 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 Q8IYB0 196 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 OR5R1Q8NH85 324 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 COQ2Q96H96 371 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 FOXJ3Q9UPW0 622 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 A0A0G2JK05 382 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PPE2 198 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PR64 198 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PRV1 198 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 hADV38S2A0JD32 116 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 GABRPO00591 440 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 SH2D1BO14796 132 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 MGST3O14880 152 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TSPAN15O95858 294 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 GNAO1P09471 354 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 P2RX3P56373 397 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 FBLN7Q53RD9 439 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 Q6ZS46 218 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 JAM3Q9BX67 310 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TCF7L1Q9HCS4 588 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 INPP5EQ9NRR6 644 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 XPNPEP2O43895 674 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 CDRT1O95170 752 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 IGHV3-7P01780 117 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 CCDC159P0C7I6 412 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 RAB3AP20336 220 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 CD24P25063 80 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 GABRA5P31644 462 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 OR3A4PP47883 348 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 PIGYQ3MUY2 71 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-213ENST00000494956 ZNF529Q6P280 563 aa8.56□□□□□ -1.04
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