RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635841.1

XIST-211, X inactive specific transcript, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene XIST, Length 1,734 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIST-211ENST00000635841 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
XIST-211ENST00000635841 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
XIST-211ENST00000635841 PECRQ9BY49 303 aa7.47□□□□□ -1.21
XIST-211ENST00000635841 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
XIST-211ENST00000635841 SAP30LQ9HAJ7 183 aa7.47□□□□□ -1.21
XIST-211ENST00000635841 PALMDQ9NP74 551 aa7.47□□□□□ -1.21
XIST-211ENST00000635841 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.47□□□□□ -1.21
XIST-211ENST00000635841 RASL12Q9NYN1 266 aa7.47□□□□□ -1.21
XIST-211ENST00000635841 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.47□□□□□ -1.21
XIST-211ENST00000635841 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.47□□□□□ -1.21
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XIST-211ENST00000635841 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 SOD3P08294 240 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 IL7P13232 177 aa7.46□□□□□ -1.22
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XIST-211ENST00000635841 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
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XIST-211ENST00000635841 ARL6IP1Q15041 203 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 PDCD1Q15116 288 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 DTX2Q86UW9 622 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 OR52I2Q8NH67 350 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 Q8TCH9 128 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 HPS1Q92902 700 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 WDR13Q9H1Z4 485 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 HES4Q9HCC6 221 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 RNF7Q9UBF6 113 aa7.46□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 DSCAMO60469 2012 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 A0A1W2PQ09 198 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 MEIOCA2RUB1 952 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 SRRM5B3KS81 715 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 H3BUI4 141 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 SH2D1BO14796 132 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 DEGS1O15121 323 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 LANCL1O43813 399 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 PDCD6O75340 191 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 CD8AP01732 235 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 MELTFP08582 738 aa7.45□□□□□ -1.22
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XIST-211ENST00000635841 CHATP28329 748 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 GNG2P59768 71 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 IFITM3Q01628 133 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 GUCA2AQ02747 115 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 MPV17LQ2QL34 196 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 HACD4Q5VWC8 232 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 STEAP3Q658P3 488 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 YIPF5Q969M3 257 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 TREM2Q9NZC2 230 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 DNAJB11Q9UBS4 358 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 GLS2Q9UI32 602 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 HSF4Q9ULV5 492 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 NPTNQ9Y639 398 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 TACC2O95359 2948 aa7.45□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 FAM221AA4D161 298 aa7.44□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.44□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 SERPINE3A8MV23 424 aa7.44□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 SULT1C2O00338 296 aa7.44□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 MFNGO00587 321 aa7.44□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 GPR37O15354 613 aa7.44□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 LHBP01229 141 aa7.44□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 HPXP02790 462 aa7.44□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 LPLP06858 475 aa7.44□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 ZNF44P15621 663 aa7.44□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 EGR1P18146 543 aa7.44□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 TLE4Q04727 773 aa7.44□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 ARFRP1Q13795 201 aa7.44□□□□□ -1.22
XIST-211ENST00000635841 ZNF146Q15072 292 aa7.44□□□□□ -1.22
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