RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 CAMK2BQ13554 666 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 METTL11BQ5VVY1 283 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 RAB12Q6IQ22 244 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 OR11H4Q8NGC9 324 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 TEX46H3BTG2 121 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 KCNAB3O43448 404 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 NDUFB6O95139 128 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 BPNT1O95861 308 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 NPBWR2P48146 333 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 ERVS71-1P61550 626 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 ALKBH6Q3KRA9 238 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 VWA1Q6PCB0 445 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 ZADH2Q8N4Q0 377 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 WDYHV1Q96HA8 205 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 SLC17A5Q9NRA2 495 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 EHFQ9NZC4 300 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 NPAP1Q9NZP6 1156 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 C5orf51A6NDU8 294 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 CDRT15L2A8MXV6 281 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 DISC1C4P0D8 188 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF35P13682 527 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 CA6P23280 308 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 HOXC12P31275 282 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 GZMKP49863 264 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 FABP6P51161 128 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 FOXF2Q12947 444 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 KCNMB1Q16558 191 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF260Q3ZCT1 412 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 CHRFAM7AQ494W8 412 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 OR5T2Q8NGG2 359 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 CMTM3Q96MX0 182 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 ST3GAL6Q9Y274 331 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 MED13LQ71F56 2210 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 TRAV17A0A0B4J275 112 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 NAP1L6A6NFF2 107 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 HS3ST1O14792 307 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 SFTPBP07988 381 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 GABRA1P14867 456 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 ARPC4P59998 168 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 IL13RA1P78552 427 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 FAM3AP98173 230 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 MDP1Q86V88 176 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 CALHM1Q8IU99 346 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 OR56B1Q8NGI3 324 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 SLAMF9Q96A28 289 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 UQCC2Q9BRT2 126 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 CRIM1Q9NZV1 1036 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 DNPH1O43598 174 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 LILRA1O75019 489 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 GRPP07492 148 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 HACD4Q5VWC8 232 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 C17orf78Q8N4C9 275 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 OR5H2Q8NGV7 314 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 PP6455Q8WZ26 134 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 CHST5Q9GZS9 411 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 METTL9Q9H1A3 318 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 GSKIPQ9P0R6 139 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 KCNMB2Q9Y691 235 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 TRAV39A0A0B4J263 110 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 EFSO43281 561 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 ERP29P30040 261 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 BCL2A1Q16548 175 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 NLRC3Q7RTR2 1065 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 OR8H3Q8N146 312 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF732B4DXR9 585 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 CEACAM1P13688 526 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 THBS4P35443 961 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 CDK10Q15131 360 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 RPRMLQ8N4K4 120 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF611Q8N823 705 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 SNAPC3Q92966 411 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 IL36RNQ9UBH0 155 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 DUSP13Q9UII6 198 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 ACTL6AO96019 429 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 OR4E1P0C645 316 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 ATP1B3P54709 279 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 ZP1P60852 638 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 SORDQ00796 357 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 MICBQ29980 383 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 DCAF12L2Q5VW00 463 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 FBXW9Q5XUX1 488 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 RDH5Q92781 318 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 EXTL1Q92935 676 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRK-216ENST00000524481 FBXW5Q969U6 566 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.6 ms