RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 OR52H1Q8NGJ2 320 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 OR4K15Q8NH41 348 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ITPKCQ96DU7 683 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 FXYD6Q9H0Q3 95 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 STARD10Q9Y365 291 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 TM4SF5O14894 197 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 CDC14BO60729 498 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 APOC1P02654 83 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 GPM6AP51674 278 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 TAS2R19P59542 299 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PCBD1P61457 104 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ECH1Q13011 328 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 POU4F3Q15319 338 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PIGYQ3MUY2 71 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 OR51F2Q8NH61 342 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 MOB1AQ9H8S9 216 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 CA10Q9NS85 328 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 COPZ2Q9P299 210 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 GPR160Q9UJ42 338 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 SLC7A11Q9UPY5 501 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PLCE1Q9P212 2302 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 SYNGR3O43761 229 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 HPNP05981 417 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 GSK3AP49840 483 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 DLX5P56178 289 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 OR2T2Q6IF00 324 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 DRAM2Q6UX65 266 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 C15orf40Q8WUR7 153 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 HAS2Q92819 552 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 LPAR5Q9H1C0 372 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 GHITMQ9H3K2 345 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 TAS2R8Q9NYW2 309 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PIEZO1Q92508 2521 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 K7EM74 188 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 TERTO14746 1132 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 FXYD4P59646 89 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 BEX5Q5H9J7 111 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PLAC9Q5JTB6 97 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 C5orf24Q7Z6I8 188 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM17Q86X19 198 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 FTMTQ8N4E7 242 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 TOMM40LQ969M1 308 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF488Q96MN9 340 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF442Q9H7R0 627 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM82A0PJX8 343 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 SLC22A5O76082 557 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 CELA3BP08861 270 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 VSIG10L2P0DP72 767 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 FSTP19883 344 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 APLNRP35414 380 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 HAAOP46952 286 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 RBP2P50120 134 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 VHLLQ6RSH7 139 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 FBXL14Q8N1E6 418 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 MDS2Q8NDY4 140 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 UBALD1Q8TB05 177 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 MARCH1Q8TCQ1 289 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 A0A0A6YYD4 124 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 WIPF3A6NGB9 483 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 CTDSPLO15194 276 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ICMTO60725 284 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 CST2P09228 141 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM50BP56557 158 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 IFITM2Q01629 132 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 SLC9A3R2Q15599 337 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 C2orf68Q2NKX9 166 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 C1orf100Q5SVJ3 147 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 FAM166AQ6J272 317 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PRR18Q8N4B5 295 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 GPX8Q8TED1 209 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 SCMH1Q96GD3 660 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ACTR6Q9GZN1 396 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ACKR4Q9NPB9 350 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 DLL3Q9NYJ7 618 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 SHANK1Q9Y566 2161 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 OR6C6A6NF89 314 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ARPC5O15511 151 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 BTG1P62324 171 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 MALLQ13021 153 aa10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.3 ms