RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC2A1	P11166	492 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GRSF1-208	ENST00000545193	MAGEA5	P43359	124 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.2
GRSF1-208	ENST00000545193	SPOCK1	Q08629	439 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GRSF1-208	ENST00000545193	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.2
GRSF1-208	ENST00000545193	LRRC18	Q8N456	261 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GRSF1-208	ENST00000545193	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.2
GRSF1-208	ENST00000545193	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GRSF1-208	ENST00000545193	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF175	Q9Y473	711 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM235	A6NFC5	223 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ARGFX	A6NJG6	315 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM166B	A8MTA8	275 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM25E	A8MYX2	175 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF84	P51523	738 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	TAS2R19	P59542	299 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ACTB	P60709	375 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ACTG1	P63261	375 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	DHRS2	Q13268	280 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	GJC3	Q8NFK1	279 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	GLS2	Q9UI32	602 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	MEGF11	A6BM72	1044 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SP1	P08047	785 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CD37	P11049	281 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	HTR2C	P28335	458 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CX3CR1	P49238	355 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CCDC107	Q8WV48	283 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC6A7	Q99884	636 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	IFT22	Q9H7X7	185 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A1B0GTI1	187 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	MGMT	P16455	207 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	LHX2	P50458	406 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	AKR1C2	P52895	323 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	AKR1C1	Q04828	323 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	AAED1	Q7RTV5	226 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	MDS2	Q8NDY4	140 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	OR5H15	A6NDH6	313 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CYTIP	O60759	359 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CYB5A	P00167	134 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ANOS1	P23352	680 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CD34	P28906	385 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	GNAL	P38405	381 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ABHD3	Q8WU67	409 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CMBL	Q96DG6	245 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CRLF2	Q9HC73	371 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	RASL12	Q9NYN1	266 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	UPB1	Q9UBR1	384 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	KLK13	Q9UKR3	277 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	MED13	Q9UHV7	2174 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	NME2P1	O60361	137 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	NME2	P22392	152 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CTSS	P25774	331 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	PLGLB1	Q02325	96 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SRY	Q05066	204 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	VASH2	Q86V25	355 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	UBB	P0CG47	229 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	CAPZA1	P52907	286 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ATP1B3	P54709	279 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	HIST1H3A	P68431	136 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM27B	Q5VT28	67 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GRSF1-208	ENST00000545193	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.1 ms