RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 OR2H1Q9GZK4 316 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF581Q9P0T4 197 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 RAB22AQ9UL26 194 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 RELNP78509 3460 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PCSK5Q92824 1860 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 HRH1P35367 487 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ARMC10Q8N2F6 343 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 NKAIN3Q8N8D7 197 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 OR14K1Q8NGZ2 314 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 CPT1CQ8TCG5 803 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 LRFN3Q9BTN0 628 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 MRI1Q9BV20 369 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PRR13Q9NZ81 148 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PTTG3PQ9NZH4 202 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 EMC3Q9P0I2 261 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 CCSO14618 274 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 CYTIPO60759 359 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 DHRS3O75911 302 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 MGMTP16455 207 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PTGFRP43088 359 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 TNFSF10P50591 281 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 RHOUQ7L0Q8 258 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 IP6K3Q96PC2 410 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 SPRR3Q9UBC9 169 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 FZR1Q9UM11 496 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ESPL1Q14674 2120 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 RAB27BO00194 218 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PGAM2P15259 253 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 OR8H1Q8NGG4 311 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ADGRG7Q96K78 797 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 OR2B2Q9GZK3 357 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 WNT5BQ9H1J7 359 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 UBE2QL1A1L167 161 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 NME2P1O60361 137 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 AGFG2O95081 481 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 NRASP01111 189 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 TPOP07202 933 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 NME2P22392 152 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 DNASE1P24855 282 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 NPY4RP50391 375 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PGAP1Q75T13 922 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PIP4P1Q86T03 277 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PDCD10Q9BUL8 212 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 KLK13Q9UKR3 277 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 KCNK7Q9Y2U2 307 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 KNG1P01042 644 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 SERPINA5P05154 406 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 CSF1P09603 554 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF81P51508 661 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 C10orf128Q5T292 105 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ASCL5Q7RTU5 278 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 FAM109AQ8N4B1 249 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 KCNG3Q8TAE7 436 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 POFUT1Q9H488 388 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 FANCFQ9NPI8 374 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ASCL3Q9NQ33 180 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 MED12LQ86YW9 2145 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 PRR33A8MZF0 331 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 GOSR2O14653 212 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 LPLP06858 475 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ANXA3P12429 323 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF708P17019 499 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 AMY2BP19961 511 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 S100A1P23297 94 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ACTBP60709 375 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ACTG1P63261 375 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 DYRK1AQ13627 763 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 FOXRED2Q8IWF2 684 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 OR10R2Q8NGX6 335 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 DEDD2Q8WXF8 326 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 CITED4Q96RK1 184 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 FAAP24Q9BTP7 215 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 CST11Q9H112 138 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 ZZEF1O43149 2961 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 COL12A1Q99715 3063 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 SELEP16581 610 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 RAB35Q15286 201 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 SLC25A26Q70HW3 274 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-216ENST00000524481 OR56B2PQ8NGI1 322 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.6 ms