RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W PFK26P40433 827 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W RPM2Q02773 1202 aa10.76□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W ACL4Q03771 387 aa10.76□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W YLR053CQ12026 108 aa10.76□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W HKR1P41809 1802 aa10.75□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W RPS3P05750 240 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W TCP1P12612 559 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W UGA4P32837 571 aa10.75□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W AST1P35183 429 aa10.75□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W RGD2P43556 714 aa10.75□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W INP52P50942 1183 aa10.75□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W OSH6Q02201 448 aa10.75□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W GAS5Q08193 484 aa10.75□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W ILS1P09436 1072 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W DBP5P20449 482 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W AAD3P25612 363 aa10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W MUD1P32605 298 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W SLA2P33338 968 aa10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W RRP14P36080 434 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W PCA1P38360 1216 aa10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W LAM1P38851 1228 aa10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W RLP7P40693 322 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W IAH1P41734 238 aa10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W SAE2P46946 345 aa10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W RNR4P49723 345 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W NOG2P53742 486 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W IVY1Q04934 453 aa10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W TRE1Q08919 783 aa10.74□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W PMD1P32634 1753 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W PDR1P12383 1068 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W YAK1P14680 807 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W ESS1P22696 170 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W CSG2P35206 410 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W HES1P35843 434 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W YBL028CP38202 106 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W MSR1P38714 643 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W YHL008CP38750 627 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W SMF2P38778 549 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W PDS1P40316 373 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W FIS1P40515 155 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W DIM1P41819 318 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W PHO86P46956 311 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W SET2P46995 733 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W RSM26P47141 266 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W IST1P53843 298 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W ASI1P54074 624 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W ADI1Q03677 179 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W PHM6Q05637 104 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W CDC73Q06697 393 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W WHI4Q07655 649 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W GRX6Q12438 231 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W SPE4Q12455 300 aa10.73□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W PGK1P00560 416 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W DAL2P25335 343 aa10.72□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W NPP1P25353 742 aa10.72□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W MCM5P29496 775 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W ABD1P32783 436 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W AFG2P32794 780 aa10.72□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W YKR078WP36158 585 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W DRN1P53255 507 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W PRM6Q04705 352 aa10.72□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W RGA2Q06407 1009 aa10.72□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W LAP2Q10740 671 aa10.72□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W GPM3Q12326 303 aa10.72□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W RAD10P06838 210 aa10.71□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W NUP120P35729 1037 aa10.71□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W TSC10P38342 320 aa10.71□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W DPH1P40487 425 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W AIM21P40563 679 aa10.71□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W TAF1P46677 1066 aa10.71□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W SHE10P53075 577 aa10.71□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W SOL4P53315 255 aa10.71□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W GET4Q12125 312 aa10.71□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W YDR018CQ12185 396 aa10.71□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W YVC1Q12324 675 aa10.71□□□□□ -0.69
PRP4YPR178W ENO1P00924 437 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W ADP1P25371 1049 aa10.7□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W SEC66P33754 206 aa10.7□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W UBP11P36026 717 aa10.7□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W CUE2P36075 443 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W MRX3P38172 270 aa10.7□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W FRT2P39734 528 aa10.7□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W YJL171CP46992 396 aa10.7□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W HLJ1P48353 224 aa10.7□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W CTR1P49573 406 aa10.7□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W ORM2Q06144 216 aa10.7□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W CDC24P11433 854 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data10.69□□□□□ -0.7not detected
PRP4YPR178W TRM5P38793 499 aa10.69□□□□□ -0.7
PRP4YPR178W AIM20P40451 204 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.5 ms