RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	YAF9	P53930	226 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	VTC3	Q02725	835 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	IES4	Q08561	116 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	OSH2	Q12451	1283 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	KIP1	P28742	1111 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	CBF2	P32504	956 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	SEC8	P32855	1065 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.57	□□□□□ -1.36	not detected
YCK1	YHR135C	FLR1	P38124	548 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	EXO5	P38289	585 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	YTA6	P40328	754 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	HXT8	P40886	569 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	JJJ3	P47138	172 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	ORC5	P50874	479 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	ENV11	P53246	860 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	BTN2	P53286	410 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	ESBP6	P53918	673 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	YDR278C	Q05612	105 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	YLL058W	Q12198	575 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	RMP1	Q12530	201 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		6.57	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	IME1	P21190	360 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	BYE1	P36106	594 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	SAD1	P43589	448 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	KAP114	P53067	1004 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	YGR021W	P53212	290 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	URH1	Q04179	340 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	TRM11	Q12463	433 aa		6.56	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	DAL2	P25335	343 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	KIN82	P25341	720 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	VPS35	P34110	944 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	NPP2	P39997	493 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	ACF4	P47129	309 aa		6.55	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	RRN6	P32786	894 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	MRX3	P38172	270 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	VID24	P38263	362 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	BSD2	P38356	321 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	MIC19	P43594	170 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	CPR7	P47103	393 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	BRO1	P48582	844 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	CUL3	P53202	744 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	YMR018W	Q04364	514 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	OSW2	Q12202	724 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	MAS2	P11914	482 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	TGL4	P36165	910 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	MDR1	P53258	950 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	TRS130	Q03660	1102 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	PPM1	Q04081	328 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	SYT1	Q06836	1226 aa		6.54	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	POX1	P13711	748 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	CDC42	P19073	191 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	SWI3	P32591	825 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	RGT1	P32862	1170 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	CNS1	P33313	385 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	RCK2	P38623	610 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	HIS2	P38635	335 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	CIN4	P39110	191 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	MAD1	P40957	749 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	SPR3	P41901	512 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	JJJ1	P53863	590 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	GYL1	Q04322	720 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	VTI1	Q04338	217 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	SHS1	Q07657	551 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	NUR1	Q12066	484 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	TY3A-G	Q12173	290 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	ZPS1	Q12512	249 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	TY3A-I	Q99219	290 aa		6.53	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
YCK1	YHR135C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
YCK1	YHR135C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
YCK1	YHR135C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
YCK1	YHR135C	BLI1	P35727	113 aa		6.52	□□□□□ -1.37
YCK1	YHR135C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.52	□□□□□ -1.37	RIP-Chip
YCK1	YHR135C	SGM1	P47166	707 aa		6.52	□□□□□ -1.37
YCK1	YHR135C	ATG1	P53104	897 aa		6.52	□□□□□ -1.37
YCK1	YHR135C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
YCK1	YHR135C	ECI1	Q05871	280 aa		6.52	□□□□□ -1.37
YCK1	YHR135C	SPO21	Q12411	609 aa		6.52	□□□□□ -1.37

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