RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 AGBL3Q8NEM8 1001 aa28.01■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 FBXW7Q969H0 707 aa28.01■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 SHTN1A0MZ66 631 aa28■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 SCN9AQ15858 1988 aa28■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa28■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 MROH5Q6ZUA9 1318 aa28■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 PASKQ96RG2 1323 aa28■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 TRPM4Q8TD43 1214 aa27.99■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.99■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 SAMD7Q7Z3H4 446 aa27.99■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 MEIS3Q99687 375 aa27.99■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27.98■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 GNAI3P08754 354 aa27.97■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 STRIP1Q5VSL9 837 aa27.97■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 ZNF804AQ7Z570 1209 aa27.97■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.97■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 CREBZFQ9NS37 354 aa27.97■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 UBE4AQ14139 1066 aa27.96■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 LRRC24Q50LG9 513 aa27.96■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 METTL24Q5JXM2 366 aa27.96■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 CD209Q9NNX6 404 aa27.96■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 TTLL5Q6EMB2 1281 aa27.95■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa27.95■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 TNNQ9UQP3 1299 aa27.94■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 MYO3BQ8WXR4 1341 aa27.94■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 USP17L8P0C7I0 530 aa27.94■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 KLRG1Q96E93 195 aa27.94■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 ZNF609O15014 1411 aa27.93■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 TMEM88BA6NKF7 163 aa27.93■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 GTF2IP78347 998 aa27.93■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa27.93■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 DACT2Q5SW24 774 aa27.93■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 PGAP2Q9UHJ9 254 aa27.93■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 IRS2Q9Y4H2 1338 aa27.93■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 OGFOD1Q8N543 542 aa27.92■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 GMLQ99445 158 aa27.92■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 EYA2O00167 538 aa27.91■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 PDE8BO95263 885 aa27.91■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 PSME4Q14997 1843 aa27.9■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 EGFRP00533 1210 aa27.9■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.9■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 MXD3Q9BW11 206 aa27.9■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 IL1R1P14778 569 aa27.9■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 CDC37L1Q7L3B6 337 aa27.9■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 A0A1B0GUL6 1792 aa27.89■■■□□ 2.06
SYT6-210ENST00000641643 VPS37DQ86XT2 251 aa27.89■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 MYOZ2Q9NPC6 264 aa27.89■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 FBXO3Q9UK99 471 aa27.89■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 TRAF5O00463 557 aa27.88■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 GNAI2P04899 355 aa27.88■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 VGLL2Q8N8G2 317 aa27.87■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 SIL1Q9H173 461 aa27.87■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 GYG1P46976 350 aa27.86■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 MMP14P50281 582 aa27.86■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 CAVIN4Q5BKX8 364 aa27.86■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 HDAC9Q9UKV0 1011 aa27.86■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 SRGAP3O43295 1099 aa27.86■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 KIAA0825Q8IV33 1275 aa27.86■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.86■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 CIAO1O76071 339 aa27.85■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 SASH1O94885 1247 aa27.85■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 SCARF1Q14162 830 aa27.85■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 KRT26Q7Z3Y9 468 aa27.85■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 USP48Q86UV5 1035 aa27.84■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 GGA3Q9NZ52 723 aa27.84■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 ATG9AQ7Z3C6 839 aa27.83■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 COPRSQ9NQ92 184 aa27.83■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 CEP126Q9P2H0 1117 aa27.83■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 JAG2Q9Y219 1238 aa27.83■■■□□ 2.05
SYT6-210ENST00000641643 CELF2O95319 508 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
SYT6-210ENST00000641643 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
SYT6-210ENST00000641643 SULF1Q8IWU6 871 aa27.82■■■□□ 2.04
SYT6-210ENST00000641643 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
SYT6-210ENST00000641643 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
SYT6-210ENST00000641643 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
SYT6-210ENST00000641643 SLC5A1P13866 664 aa27.82■■■□□ 2.04
SYT6-210ENST00000641643 MTX1Q13505 466 aa27.82■■■□□ 2.04
SYT6-210ENST00000641643 FBXO33Q7Z6M2 555 aa27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms