RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

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Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 OTOP1Q7RTM1 612 aa11.22□□□□□ -0.61
HLA-B-257ENST00000640094 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa11.22□□□□□ -0.61
HLA-B-257ENST00000640094 ARAP2Q8WZ64 1704 aa11.22□□□□□ -0.61
HLA-B-257ENST00000640094 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
HLA-B-257ENST00000640094 POTEFA5A3E0 1075 aa11.21□□□□□ -0.61
HLA-B-257ENST00000640094 WNT10BO00744 389 aa11.21□□□□□ -0.61
HLA-B-257ENST00000640094 SPRYD7Q5W111 196 aa11.21□□□□□ -0.61
HLA-B-257ENST00000640094 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.21□□□□□ -0.61
HLA-B-257ENST00000640094 FBXW7Q969H0 707 aa11.21□□□□□ -0.61
HLA-B-257ENST00000640094 SEC31BQ9NQW1 1179 aa11.21□□□□□ -0.61
HLA-B-257ENST00000640094 CENPFP49454 3210 aa11.2□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 PDE8AO60658 829 aa11.2□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 SASH1O94885 1247 aa11.2□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.2□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa11.2□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.2□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 IFNL1Q8IU54 200 aa11.2□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.2□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 ARMC5Q96C12 935 aa11.2□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.2□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 BRCA2P51587 3418 aa11.19□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 UNCXA6NJT0 531 aa11.19□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 PRKG1Q13976 671 aa11.19□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 KRT24Q2M2I5 525 aa11.19□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 DACT2Q5SW24 774 aa11.19□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.19□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.19□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 PTPN22Q9Y2R2 807 aa11.19□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 SSC5DA1L4H1 1573 aa11.19□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 CHL1O00533 1208 aa11.18□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 ARHGEF6Q15052 776 aa11.18□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 WNK4Q96J92 1243 aa11.18□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 COA1Q9GZY4 146 aa11.18□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa11.18□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 EFCC1Q9HA90 598 aa11.18□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 CTSWP56202 376 aa11.17□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 MAP3K11Q16584 847 aa11.17□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 NBPF11Q86T75 865 aa11.17□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 CD99L2Q8TCZ2 262 aa11.17□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 SLC10A4Q96EP9 437 aa11.17□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 MYO1BO43795 1136 aa11.16□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 DDX58O95786 925 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 IREB2P48200 963 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 CRHR2Q13324 411 aa11.16□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa11.16□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.16□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 MYD88Q99836 296 aa11.16□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.16□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF804BA4D1E1 1349 aa11.15□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 EN2P19622 333 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 SP3Q02447 781 aa11.15□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 DLGAP5Q15398 846 aa11.15□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa11.15□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 DUSP27Q5VZP5 1158 aa11.15□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF333Q96JL9 665 aa11.15□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 MXD3Q9BW11 206 aa11.15□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.15□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 LEMD3Q9Y2U8 911 aa11.15□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 CEP290O15078 2479 aa11.15□□□□□ -0.62
HLA-B-257ENST00000640094 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa11.14□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 NEUROD2Q15784 382 aa11.14□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.14□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 TTLL5Q6EMB2 1281 aa11.14□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa11.14□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 CLMNQ96JQ2 1002 aa11.14□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 MINPP1Q9UNW1 487 aa11.14□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 KCNJ4P48050 445 aa11.13□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 TNFAIP1Q13829 316 aa11.13□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 MTMR14Q8NCE2 650 aa11.13□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 ANKRD2Q9GZV1 360 aa11.13□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa11.13□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 NEXNQ0ZGT2 675 aa11.12□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 GREM2Q9H772 168 aa11.12□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 GTF2IP78347 998 aa11.11□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 KIF22Q14807 665 aa11.11□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 RUNDC1Q96C34 613 aa11.11□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 VEZTQ9HBM0 779 aa11.11□□□□□ -0.63
HLA-B-257ENST00000640094 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa11.11□□□□□ -0.63
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