RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 OGFOD1Q8N543 542 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3-209ENST00000616395 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 SASH1O94885 1247 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 DACT2Q5SW24 774 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 FZD1Q9UP38 647 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 ATP2B4P23634 1241 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 INHBEP58166 350 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARMC5Q96C12 935 aa22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 BRCA2P51587 3418 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 ERO1AQ96HE7 468 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 FBXW7Q969H0 707 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 CHL1O00533 1208 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 MRS2Q9HD23 443 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 EFCC1Q9HA90 598 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 HYPKQ9NX55 129 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 MED23Q9ULK4 1368 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 CRHR2Q13324 411 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 WNK4Q96J92 1243 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 PDE8AO60658 829 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 CAP1Q01518 475 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 HOXB7P09629 217 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 MAP3K11Q16584 847 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF333Q96JL9 665 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 H0YGN5 161 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 MMP14P50281 582 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 SP3Q02447 781 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYD88Q99836 296 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 COA1Q9GZY4 146 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 GOLGA2Q08379 1002 aa22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 NEUROD2Q15784 382 aa22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 OTUD5Q96G74 571 aa22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 SZT2Q5T011 3432 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 LAMB1P07942 1786 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 GJA5P36382 358 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTPN18Q99952 460 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 UNCXA6NJT0 531 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 DLL1O00548 723 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 KLRK1P26718 216 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 CTSWP56202 376 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 GTF2IP78347 998 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 DLGAP5Q15398 846 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 NBPF11Q86T75 865 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-209ENST00000616395 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC184Q52MB2 194 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-209ENST00000616395 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.57■■□□□ 1.2
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