RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 MINPP1Q9UNW1 487 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 ST18O60284 1047 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 BBOX1O75936 387 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF20Q5VTR2 975 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC102BQ68D86 513 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 VPS37DQ86XT2 251 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 CRY2Q49AN0 593 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 SNRKQ9NRH2 765 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 CASZ1Q86V15 1759 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 SEMA3EO15041 775 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 SNX21Q969T3 373 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 CRAMP1Q96RY5 1269 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
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CAPNS1-212ENST00000591041 TAF5LO75529 589 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 LEMD3Q9Y2U8 911 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-212ENST00000591041 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 DDR1Q08345 913 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 IGSF3O75054 1194 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 MCM2P49736 904 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC171Q6TFL3 1326 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 MMP10P09238 476 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 ALDH1B1P30837 517 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA5Q8NB90 893 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 XDHP47989 1333 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 NPR1P16066 1061 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPA4P34932 840 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 ZAP70P43403 619 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP3K12Q12852 859 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.17■■□□□ 1.94
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CAPNS1-212ENST00000591041 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 DENND2AQ9ULE3 1009 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB22O15209 634 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 PHKA1P46020 1223 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 WASHC4Q2M389 1173 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM227BQ96M60 508 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 HMG20BQ9P0W2 317 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
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CAPNS1-212ENST00000591041 MCAMP43121 646 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF804BA4D1E1 1349 aa27.15■■□□□ 1.94
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CAPNS1-212ENST00000591041 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0D9SFI3 127 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT32Q14532 448 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-212ENST00000591041 APPBP2Q92624 585 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-212ENST00000591041 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMA5P28066 241 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP4K1Q92918 833 aa27.12■■□□□ 1.93
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CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF804AQ7Z570 1209 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-212ENST00000591041 MASTLQ96GX5 879 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-212ENST00000591041 SYT17Q9BSW7 474 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-212ENST00000591041 CTNNA3Q9UI47 895 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-212ENST00000591041 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
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CAPNS1-212ENST00000591041 MTFR1LQ9H019 292 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa27.1■■□□□ 1.93
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CAPNS1-212ENST00000591041 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
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CAPNS1-212ENST00000591041 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
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CAPNS1-212ENST00000591041 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-212ENST00000591041 SCARF1Q14162 830 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-212ENST00000591041 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-212ENST00000591041 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
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