RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-207ENST00000589146 MCAMP43121 646 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-207ENST00000589146 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNB2Q92953 911 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-207ENST00000589146 HELLSQ9NRZ9 838 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC171Q6TFL3 1326 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB22O15209 634 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-207ENST00000589146 ZAP70P43403 619 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC15A2Q16348 729 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-207ENST00000589146 ANTXR1Q9H6X2 564 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC4A3P48751 1232 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF804BA4D1E1 1349 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 PTH1RQ03431 593 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 HSCBQ8IWL3 235 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP4K1Q92918 833 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 STK32BQ9NY57 414 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 SNAP23O00161 211 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 BAG6P46379 1132 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 PALD1Q9ULE6 856 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 CRAMP1Q96RY5 1269 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 HMG20BQ9P0W2 317 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 MYH7P12883 1935 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 NECTIN1Q15223 517 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA5Q8NB90 893 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 BCAMP50895 628 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 RASGRF1Q13972 1273 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 PI16Q6UXB8 463 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.982e-6■■□□□ 12.4
CAPNS1-207ENST00000589146 BBOX1O75936 387 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO33Q7Z6M2 555 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 SNX14Q9Y5W7 946 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 DOCK2Q92608 1830 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 CHGBP05060 677 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 MMP10P09238 476 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 TMC4Q7Z404 712 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 LEMD3Q9Y2U8 911 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 IRS2Q9Y4H2 1338 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 SEMA3EO15041 775 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 ST18O60284 1047 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 CAVIN4Q5BKX8 364 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC125Q86Z20 511 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 APPBP2Q92624 585 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 ADD2P35612 726 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE3CQ15386 1083 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 MAST3O60307 1309 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNJ4P48050 445 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 TSGA10IPQ3SY00 556 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 RASEFQ8IZ41 740 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 DSCC1Q9BVC3 393 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 TM6SF1Q9BZW5 370 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC37AA6NMS7 1700 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 PDE6BP35913 854 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 GYG1P46976 350 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 CREB3L3Q68CJ9 461 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 OSBP2Q969R2 916 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 XDHP47989 1333 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-207ENST00000589146 MCM2P49736 904 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 M0R2C6 588 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC27A2O14975 620 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 NPR1P16066 1061 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 SLFNL1Q499Z3 407 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF20Q5VTR2 975 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 DENND2AQ9ULE3 1009 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 SRGNP10124 158 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 NEK4P51957 841 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-207ENST00000589146 PODXL2Q9NZ53 605 aa27.3■■□□□ 1.96
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