RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 ARHGAP4P98171 946 aa7.15□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 ECM1Q16610 540 aa7.15□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.15□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PRPF8-211ENST00000574728 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.15□□□□□ -1.26
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PRPF8-211ENST00000574728 PHF24Q9UPV7 400 aa7.15□□□□□ -1.26
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PRPF8-211ENST00000574728 E9PCH4 1651 aa7.15□□□□□ -1.27
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PRPF8-211ENST00000574728 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.14□□□□□ -1.27
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PRPF8-211ENST00000574728 PCSK2P16519 638 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-211ENST00000574728 INPP5BP32019 993 aa7.14□□□□□ -1.27
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PRPF8-211ENST00000574728 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-211ENST00000574728 ADGRB3O60242 1522 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-211ENST00000574728 H3BM21 787 aa7.13□□□□□ -1.27
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PRPF8-211ENST00000574728 GPR152Q8TDT2 470 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-211ENST00000574728 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-211ENST00000574728 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.13□□□□□ -1.27
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PRPF8-211ENST00000574728 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PRPF8-211ENST00000574728 TRPM2O94759 1503 aa7.1□□□□□ -1.27
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PRPF8-211ENST00000574728 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
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PRPF8-211ENST00000574728 STRCP1A6NGW2 1772 aa7.08□□□□□ -1.28
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PRPF8-211ENST00000574728 FAM182BQ5T319 152 aa7.08□□□□□ -1.28
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PRPF8-211ENST00000574728 IRF7Q92985 503 aa7.08□□□□□ -1.28
PRPF8-211ENST00000574728 STRN4Q9NRL3 753 aa7.08□□□□□ -1.28
PRPF8-211ENST00000574728 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.08□□□□□ -1.28
PRPF8-211ENST00000574728 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.08□□□□□ -1.28
PRPF8-211ENST00000574728 IQGAP1P46940 1657 aa7.08□□□□□ -1.28
PRPF8-211ENST00000574728 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa7.08□□□□□ -1.28
PRPF8-211ENST00000574728 CLTCL1P53675 1640 aa7.08□□□□□ -1.28
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