RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 BCAR3O75815 825 aa24.87■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 TRIM27P14373 513 aa24.87■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 CREBZFQ9NS37 354 aa24.87■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.86■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 CEP350Q5VT06 3117 aa24.86■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.86■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.86■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 PLIN1O60240 522 aa24.85■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 GNAI3P08754 354 aa24.85■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 UBE4AQ14139 1066 aa24.85■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.85■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.85■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 TRPM4Q8TD43 1214 aa24.84■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.84■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 KLRK1P26718 216 aa24.83■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 HTRA3P83110 453 aa24.83■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.83■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 FBXW7Q969H0 707 aa24.83■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 KLRG1Q96E93 195 aa24.83■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 PGAP2Q9UHJ9 254 aa24.83■■□□□ 1.57
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.82■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 MMP14P50281 582 aa24.82■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 MEIS3Q99687 375 aa24.82■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 CD209Q9NNX6 404 aa24.82■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.82■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 SHTN1A0MZ66 631 aa24.81■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 USP17L8P0C7I0 530 aa24.81■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.81■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 METTL24Q5JXM2 366 aa24.81■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 DACT2Q5SW24 774 aa24.81■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.81■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.81■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 FBXO3Q9UK99 471 aa24.81■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 SNAP23O00161 211 aa24.8■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 OGFOD1Q8N543 542 aa24.8■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 GMLQ99445 158 aa24.8■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.79■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 IL1R1P14778 569 aa24.79■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 LRRC24Q50LG9 513 aa24.79■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.79■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.79■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.78■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 PDE8BO95263 885 aa24.78■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 GTF2IP78347 998 aa24.78■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 EYA2O00167 538 aa24.77■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
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CMTM3-211ENST00000565922 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.77■■□□□ 1.56
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CMTM3-211ENST00000565922 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.77■■□□□ 1.56
CMTM3-211ENST00000565922 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.76■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.75■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 CIAO1O76071 339 aa24.75■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.75■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 VPS37DQ86XT2 251 aa24.75■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.75■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 EGFRP00533 1210 aa24.74■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 GNAI2P04899 355 aa24.74■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.74■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 TNNQ9UQP3 1299 aa24.74■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 TRAF5O00463 557 aa24.73■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 MTX1Q13505 466 aa24.73■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 CNTNAP1P78357 1384 aa24.72■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 SASH1O94885 1247 aa24.72■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 MS4A1P11836 297 aa24.72■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.72■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 SULF1Q8IWU6 871 aa24.72■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 JMYQ8N9B5 988 aa24.72■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 MXD3Q9BW11 206 aa24.72■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 COPRSQ9NQ92 184 aa24.72■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 GGA3Q9NZ52 723 aa24.72■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.71■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 SRGAP3O43295 1099 aa24.71■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 GYG1P46976 350 aa24.71■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.71■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 SIL1Q9H173 461 aa24.71■■□□□ 1.55
CMTM3-211ENST00000565922 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.7■■□□□ 1.54
CMTM3-211ENST00000565922 SLC5A1P13866 664 aa24.7■■□□□ 1.54
CMTM3-211ENST00000565922 SCARF1Q14162 830 aa24.7■■□□□ 1.54
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