RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 IFNL1Q8IU54 200 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa17.9■□□□□ 0.46
CS-231ENST00000552222 DLL1O00548 723 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-231ENST00000552222 SREBF2Q12772 1141 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-231ENST00000552222 CFHR5Q9BXR6 569 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-231ENST00000552222 PODXL2Q9NZ53 605 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-231ENST00000552222 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa17.89■□□□□ 0.45
CS-231ENST00000552222 USP17L3A6NCW0 530 aa17.88■□□□□ 0.45
CS-231ENST00000552222 USP17L4A6NCW7 530 aa17.88■□□□□ 0.45
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CS-231ENST00000552222 USP17L1Q7RTZ2 530 aa17.88■□□□□ 0.45
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CS-231ENST00000552222 DACT2Q5SW24 774 aa17.86■□□□□ 0.45
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CS-231ENST00000552222 ARMC5Q96C12 935 aa17.86■□□□□ 0.45
CS-231ENST00000552222 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
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CS-231ENST00000552222 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
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CS-231ENST00000552222 NEUROD2Q15784 382 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-231ENST00000552222 ARMC9Q7Z3E5 817 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-231ENST00000552222 WNK4Q96J92 1243 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-231ENST00000552222 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CS-231ENST00000552222 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-231ENST00000552222 PSME4Q14997 1843 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-231ENST00000552222 SSC5DA1L4H1 1573 aa17.83■□□□□ 0.45
CS-231ENST00000552222 NF2P35240 595 aa17.83■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 LMOD3Q0VAK6 560 aa17.83■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 KIAA0825Q8IV33 1275 aa17.83■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 SLC10A4Q96EP9 437 aa17.83■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 EFCC1Q9HA90 598 aa17.83■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.83■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa17.83■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 ZNF333Q96JL9 665 aa17.82■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 SLC17A8Q8NDX2 589 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 ALDH1A1P00352 501 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 PODNQ7Z5L7 613 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 SH3TC2Q8TF17 1288 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.8■□□□□ 0.44
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CS-231ENST00000552222 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 CLRN2A0PK11 232 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 ATP2B4P23634 1241 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 SP3Q02447 781 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 CCDC27Q2M243 656 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 OGFOD1Q8N543 542 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa17.77■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 MINPP1Q9UNW1 487 aa17.77■□□□□ 0.44
CS-231ENST00000552222 SNAP23O00161 211 aa17.76■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 CCDC152Q4G0S7 254 aa17.76■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 RIC3Q7Z5B4 369 aa17.76■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 CDAN1Q8IWY9 1227 aa17.76■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 F8W031 263 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 CHL1O00533 1208 aa17.75■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 USP2O75604 605 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 GTF2IP78347 998 aa17.75■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa17.75■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 WWC1Q8IX03 1113 aa17.75■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 CERS5Q8N5B7 392 aa17.75■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 ELP3Q9H9T3 547 aa17.75■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 JAG2Q9Y219 1238 aa17.75■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 CEP290O15078 2479 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 PDE8AO60658 829 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 INHBEP58166 350 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 MTFR1Q15390 333 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 STRIP1Q5VSL9 837 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 TTLL5Q6EMB2 1281 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 SHISA4Q96DD7 197 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-231ENST00000552222 GREM2Q9H772 168 aa17.74■□□□□ 0.43
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