RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482337.5

KIAA0907-208, Transcript of Protein BLOM7, human

TSL 1 (best)

Gene KIAA0907, Length 1,135 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIAA0907-208	ENST00000482337	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.23	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.23	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	USP17L3	A6NCW0	530 aa		13.22	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	USP17L4	A6NCW7	530 aa		13.22	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	INHBE	P58166	350 aa		13.22	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		13.22	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		13.22	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	CEP290	O15078	2479 aa		13.22	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	SPEF2	Q9C093	1822 aa		13.21	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	GJA5	P36382	358 aa		13.21	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.21	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	DPF3	Q92784	378 aa		13.21	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.21	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		13.21	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	LRCH3	Q96II8	777 aa		13.21	□□□□□ -0.29
KIAA0907-208	ENST00000482337	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.2	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.2	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	FBXW7	Q969H0	707 aa		13.2	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	PTPN18	Q99952	460 aa		13.2	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.19	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	DACT2	Q5SW24	774 aa		13.19	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.19	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.18	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	OGFOD1	Q8N543	542 aa		13.18	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.18	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	COL6A3	P12111	3177 aa		13.18	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.17	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	PODN	Q7Z5L7	613 aa		13.17	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.17	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	XDH	P47989	1333 aa		13.16	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	MTFR1	Q15390	333 aa		13.16	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	NFE2L2	Q16236	605 aa		13.15	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		13.15	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.15	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	MED23	Q9ULK4	1368 aa		13.15	□□□□□ -0.3
KIAA0907-208	ENST00000482337	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	ATP2B4	P23634	1241 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	PPP2R1A	P30153	589 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.14	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.13	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337		A0A1W2PPC1	479 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	NEFM	P07197	916 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337		Q7L0L9	218 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	AOX1	Q06278	1338 aa		13.12	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	ALPK3	Q96L96	1907 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		13.11	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	KLRK1	P26718	216 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.1	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.09	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.09	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	GJA8	P48165	433 aa		13.09	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	DLGAP5	Q15398	846 aa		13.09	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	CCL15	Q16663	113 aa		13.09	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	DEFB123	Q8N688	67 aa		13.09	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	COA1	Q9GZY4	146 aa		13.09	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.09	□□□□□ -0.31
KIAA0907-208	ENST00000482337	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.09	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 275 ms