RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	SNAP23	O00161	211 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	PDE4A	P27815	886 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	PDE1A	P54750	535 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	AOX1	Q06278	1338 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	ADORA1	P30542	326 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	RGS3	P49796	1198 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC51A	Q86UW1	340 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602		G3V3G9	751 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZBTB22	O15209	634 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATP5J	P18859	108 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	BCAM	P50895	628 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	SEMA3E	O15041	775 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	KLRK1	P26718	216 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	PHKA1	P46020	1223 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	GYG1	P46976	350 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SH3BP4-208	ENST00000462602	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	CACNA1S	Q13698	1873 aa		11.46	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	PPIP5K2	O43314	1243 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	LTBP1	Q14766	1721 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	GRIN3B	O60391	1043 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	IL1R1	P14778	569 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	GPR162	Q16538	588 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	AOC3	Q16853	763 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	TTC22	Q5TAA0	569 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	PODN	Q7Z5L7	613 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	SKAP1	Q86WV1	359 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	HAUS7	Q99871	368 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	NFKBIE	O00221	500 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	JDP2	Q8WYK2	163 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	MCAM	P43121	646 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	RASGRF1	Q13972	1273 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	NIM1K	Q8IY84	436 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	EVI5L	Q96CN4	794 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SH3BP4-208	ENST00000462602	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		11.41	□□□□□ -0.58

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