RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	HACL1	Q9UJ83	578 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	TOMM70	O94826	608 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	MMP14	P50281	582 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	DOK7	Q18PE1	504 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	DPF2	Q92785	391 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	COG6	Q9Y2V7	657 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	USP17L3	A6NCW0	530 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	USP17L4	A6NCW7	530 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	PSMD14	O00487	310 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	RAD17	O75943	681 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	IL1R1	P14778	569 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	FGFR2	P21802	821 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	SCNN1D	P51172	638 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	LPIN2	Q92539	896 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB22	O15209	634 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	CEP85	Q6P2H3	762 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	SIL1	Q9H173	461 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	CD209	Q9NNX6	404 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		18.14	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	SLC5A1	P13866	664 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	KLRK1	P26718	216 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	EPHX2	P34913	555 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	FSTL1	Q12841	308 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		18.14	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SNAP23	O00161	211 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	HMMR	O75330	724 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	18.13	■□□□□ 0.49	2e-6	■■■■□ 24.8
PTPA-222	ENST00000445241	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		18.13	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	LDHD	Q86WU2	507 aa		18.12	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	18.12	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		18.12	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	18.12	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241		H7C1D1	291 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SASH1	O94885	1247 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	C1QTNF8	P60827	252 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	AAMP	Q13685	434 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ATP2B3	Q16720	1220 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	DACT2	Q5SW24	774 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	VPS37D	Q86XT2	251 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	GML	Q99445	158 aa		18.11	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		18.1	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	EPS15	P42566	896 aa		18.1	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	GPR108	Q9NPR9	543 aa		18.1	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	GYG1	P46976	350 aa		18.09	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	18.09	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		18.09	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	MICALL2	Q8IY33	904 aa		18.09	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	18.09	■□□□□ 0.49
PTPA-222	ENST00000445241	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.48
PTPA-222	ENST00000445241	SEMA3E	O15041	775 aa		18.07	■□□□□ 0.48
PTPA-222	ENST00000445241	USP17L8	P0C7I0	530 aa		18.07	■□□□□ 0.48
PTPA-222	ENST00000445241	GTF2I	P78347	998 aa		18.07	■□□□□ 0.48
PTPA-222	ENST00000445241	TFCP2	Q12800	502 aa		18.07	■□□□□ 0.48
PTPA-222	ENST00000445241	CHADL	Q6NUI6	762 aa		18.07	■□□□□ 0.48
PTPA-222	ENST00000445241	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		18.07	■□□□□ 0.48
PTPA-222	ENST00000445241	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1B0GUL7	405 aa		18.06	■□□□□ 0.48
PTPA-222	ENST00000445241	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48
PTPA-222	ENST00000445241	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48

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