RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 MS4A1P11836 297 aa22.5■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.5■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 A0A1B0GUL6 1792 aa22.49■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 UBE4AQ14139 1066 aa22.49■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 MTX1Q13505 466 aa22.48■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 LDHDQ86WU2 507 aa22.48■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 SIL1Q9H173 461 aa22.48■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 USP17L3A6NCW0 530 aa22.47■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 USP17L4A6NCW7 530 aa22.47■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 SRGAP3O43295 1099 aa22.47■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 CHADLQ6NUI6 762 aa22.47■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.47■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 DPF2Q92785 391 aa22.47■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 FBXW7Q969H0 707 aa22.47■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 CD209Q9NNX6 404 aa22.47■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.47■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 SHTN1A0MZ66 631 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 PDE8BO95263 885 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 MICALL2Q8IY33 904 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 COPRSQ9NQ92 184 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 FBXO3Q9UK99 471 aa22.46■■□□□ 1.19
HERC3-205ENST00000426683 SCN9AQ15858 1988 aa22.45■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 H7C1D1 291 aa22.45■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 CIAO1O76071 339 aa22.45■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 HSPA6P17066 643 aa22.45■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.45■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.45■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.43■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 GYG1P46976 350 aa22.43■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 DACT2Q5SW24 774 aa22.43■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.43■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.43■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 IL1R1P14778 569 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 GTF2IP78347 998 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 MXD3Q9BW11 206 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 COG6Q9Y2V7 657 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 ZNF609O15014 1411 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 GMLQ99445 158 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 FGFR2P21802 821 aa22.4■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 ATP8B2P98198 1209 aa22.4■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.4■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.39■■□□□ 1.18
HERC3-205ENST00000426683 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 PDE3AQ14432 1141 aa22.39■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.39■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.39■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 VPS37DQ86XT2 251 aa22.39■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 USP17L8P0C7I0 530 aa22.38■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 SLC5A1P13866 664 aa22.38■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.38■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 CNTROBQ8N137 903 aa22.38■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 LPIN2Q92539 896 aa22.38■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 PSME4Q14997 1843 aa22.38■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 EGFRP00533 1210 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 APLP1P51693 650 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 POLA2Q14181 598 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 ATP2B3Q16720 1220 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 JAG2Q9Y219 1238 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 SASH1O94885 1247 aa22.36■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 BCAMP50895 628 aa22.36■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 SSH3Q8TE77 659 aa22.36■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 CEP85Q6P2H3 762 aa22.35■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.35■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 PASKQ96RG2 1323 aa22.34■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 TFCP2Q12800 502 aa22.34■■□□□ 1.17
HERC3-205ENST00000426683 OGFOD1Q8N543 542 aa22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms