RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT222Q8N1A0 295 aa21.47■■□□□ 1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.47■■□□□ 1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.47■■□□□ 1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 SKILP12757 684 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 TERF2Q15554 542 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 COPS6Q7L5N1 327 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP45Q9UL16 551 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A087WWV3 80 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 FGD1P98174 961 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 STRN4Q9NRL3 753 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM53CQ9NYF3 392 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-208ENST00000424082 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 PPFIA3O75145 1194 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 COPRSQ9NQ92 184 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 DCAF5Q96JK2 942 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 CCZ1BP86790 482 aa21.44■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 ERO1AQ96HE7 468 aa21.44■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.44■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC69A6NI79 296 aa21.44■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 STX1AQ16623 288 aa21.44■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.44■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.43■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCA3Q99758 1704 aa21.43■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.43■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.43■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 C5P01031 1676 aa21.43■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.43■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.43■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 USP16Q9Y5T5 823 aa21.43■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.42■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 CTAGE5O15320 804 aa21.41■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 CTDNEP1O95476 244 aa21.41■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 ELF2Q15723 593 aa21.41■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.41■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 PFKFB2O60825 505 aa21.41■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 APOBRQ0VD83 1088 aa21.41■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.41■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 USP28Q96RU2 1077 aa21.41■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 KCND1Q9NSA2 647 aa21.41■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.4■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.4■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 HAUS7Q99871 368 aa21.4■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.4■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 BECN2A8MW95 431 aa21.4■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 CABP4P57796 275 aa21.4■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0G2JLW4 131 aa21.39■■□□□ 1.02
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.39■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 GUCY1B3Q02153 619 aa21.39■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 LAMA4Q16363 1823 aa21.39■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 EVA1CP58658 441 aa21.38■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXW7Q969H0 707 aa21.38■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.38■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.38■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.38■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.38■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.37■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.37■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 KINO60870 393 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 ANO10Q9NW15 660 aa21.37■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC66A2RUB6 948 aa21.36■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLIM4O00461 696 aa21.36■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 IL2RBP14784 551 aa21.36■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 ME1P48163 572 aa21.36■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 CHST3Q7LGC8 479 aa21.36■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.36■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.36■■□□□ 1.01
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A087WZG4 1122 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms