RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397787.5

COL18A1-AS1-201, COL18A1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COL18A1-AS1, Length 3,425 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DDB1Q16531 1140 aa15.96■□□□□ 0.15
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa15.96■□□□□ 0.15
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RUFY2Q8WXA3 655 aa15.96■□□□□ 0.15
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NGLY1Q96IV0 654 aa15.96■□□□□ 0.15
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 URI1O94763 535 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa15.96■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa15.96■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 KINO60870 393 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ME1P48163 572 aa15.95■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.95■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.95■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RAD50Q92878 1312 aa15.95■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ECHDC1Q9NTX5 307 aa15.95■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SGSM2O43147 1006 aa15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 C10orf67Q8IYJ2 551 aa15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 UBXN4Q92575 508 aa15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 KAZALD1Q96I82 304 aa15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FSD1Q9BTV5 496 aa15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 OSBPL3Q9H4L5 887 aa15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SLU7O95391 586 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TEX35Q5T0J7 233 aa15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 AOPEPQ8N6M6 819 aa15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CTIFO43310 598 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TMC6Q7Z403 805 aa15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PXDNLA1KZ92 1463 aa15.93■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 JAK2O60674 1132 aa15.93■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DNAI1Q9UI46 699 aa15.93■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LMO7Q8WWI1 1683 aa15.93■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa15.93■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FAM89AQ96GI7 184 aa15.93■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PDCP20941 246 aa15.92■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 EPC1Q9H2F5 836 aa15.92■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.92■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.92■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ATG3Q9NT62 314 aa15.92■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SASH1O94885 1247 aa15.91■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GYS2P54840 703 aa15.91■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TFCP2Q12800 502 aa15.91■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FAM227BQ96M60 508 aa15.91■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 STAP2Q9UGK3 403 aa15.91■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LRRC8AQ8IWT6 810 aa15.91■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CCT2P78371 535 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PDILTQ8N807 584 aa15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 BRF1Q92994 677 aa15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TTLL5Q6EMB2 1281 aa15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FUCA2Q9BTY2 467 aa15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MTX1Q13505 466 aa15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PI4K2BQ8TCG2 481 aa15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LMAN1P49257 510 aa15.89■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CCDC57Q2TAC2 916 aa15.89■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa15.88■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LRRN4CLQ8ND94 238 aa15.88■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TOMM22Q9NS69 142 aa15.88■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 KRBA2Q6ZNG9 492 aa15.88■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TMEM87AQ8NBN3 555 aa15.88■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ERO1AQ96HE7 468 aa15.88■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa15.88■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ATP6V1AP38606 617 aa15.88■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 KCNQ4P56696 695 aa15.88■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GOLGA8FQ08AF8 430 aa15.88■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa15.88■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CCDC171Q6TFL3 1326 aa15.88■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 KDM3BQ7LBC6 1761 aa15.88■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CEP57L1Q8IYX8 460 aa15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms