RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088356.9

Usf3-201, Transcript of Gene model 608, (NCBI), mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Usf3, Length 757 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3-201ENSMUST00000088356 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sik3Q6P4S6 1311 aa22.11■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Casp1P29452 402 aa22.11■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sv2bQ8BG39 683 aa22.11■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Col3a1P08121 1464 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ifi207E9Q3L4 978 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Slc38a10Q5I012 1090 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Neurod2Q62414 383 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Slc44a4Q91VA1 707 aa22.1■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Lrch3Q8BVU0 778 aa22.09■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tmem143Q8VD26 458 aa22.09■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sh3bp5Q9Z131 463 aa22.09■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ppp1r26Q6A025 1163 aa22.08■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Osbpl5Q9ER64 874 aa22.08■■□□□ 1.13
Usf3-201ENSMUST00000088356 Zbtb3Q91X45 518 aa22.07■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm6268A2A3U9 297 aa22.06■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Armc3A2AU72 881 aa22.06■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Zap70P43404 618 aa22.06■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sez6lQ6P1D5 963 aa22.06■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 GorabQ8BRM2 368 aa22.06■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 CrbnQ8C7D2 445 aa22.06■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa22.06■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa22.06■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Nbr1P97432 988 aa22.05■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ppm1jQ149T7 507 aa22.04■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Slc10a5Q5PT54 434 aa22.04■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 HellsQ60848 821 aa22.04■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Nek9Q8K1R7 984 aa22.04■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa22.04■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Bin2D3Z6Q9 489 aa22.03■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Chl1P70232 1209 aa22.03■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Kansl1lQ5DTI6 991 aa22.03■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Krt74Q6IFZ9 495 aa22.03■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 NexnQ7TPW1 607 aa22.03■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ncor1Q60974 2453 aa22.02■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Myo1bP46735 1107 aa22.02■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Senp5Q6NXL6 749 aa22.02■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Champ1Q8K327 802 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Usf3-201ENSMUST00000088356 Vamp4O70480 141 aa22.01■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Bend3Q6PAL0 825 aa22.01■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Trnp1Q80ZI1 223 aa22.01■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sulf1Q8K007 870 aa22.01■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Dicer1Q8R418 1916 aa22.01■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Adgra2Q91ZV8 1336 aa22.01■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Cfap44E9Q5M6 1843 aa22.01■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Aifm3Q3TY86 605 aa22■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa22■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tmprss11eQ5S248 423 aa22■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Psen2Q61144 448 aa22■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Cbx2P30658 519 aa21.99■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Jarid2Q62315 1234 aa21.99■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tmc4Q7TQ65 694 aa21.99■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gpr182P43142 395 aa21.98■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Spata18Q0P557 537 aa21.98■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gnat3Q3V3I2 354 aa21.98■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ireb2Q811J3 963 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Fam155aQ8CCS2 467 aa21.98■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Polr3dQ91WD1 398 aa21.98■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 UncxO08934 530 aa21.97■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Specc1Q5SXY1 1067 aa21.97■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Rasa3Q60790 834 aa21.97■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Fam83aQ8K2P2 436 aa21.97■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Trim26Q99PN3 545 aa21.97■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa21.97■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Btbd19S4R1I0 287 aa21.97■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 GabrdP22933 449 aa21.96■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Grm8P47743 908 aa21.96■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Atoh1P48985 351 aa21.96■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gas2l2Q5SSG4 860 aa21.96■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Smc4Q8CG47 1286 aa21.96■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ralgps2Q9ERD6 590 aa21.96■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Plekho1Q9JIY0 408 aa21.96■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa21.96■■□□□ 1.11
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa21.95■■□□□ 1.1
Usf3-201ENSMUST00000088356 Irx3P81067 507 aa21.95■■□□□ 1.1
Usf3-201ENSMUST00000088356 VgfQ0VGU4 617 aa21.95■■□□□ 1.1
Usf3-201ENSMUST00000088356 Il31raQ8K5B1 716 aa21.95■■□□□ 1.1
Usf3-201ENSMUST00000088356 Apbb1Q9QXJ1 710 aa21.95■■□□□ 1.1
Usf3-201ENSMUST00000088356 Myh15E9Q264 1925 aa21.95■■□□□ 1.1
Usf3-201ENSMUST00000088356 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa21.95■■□□□ 1.1
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Usf3-201ENSMUST00000088356 Hap1O35668 628 aa21.94■■□□□ 1.1
Usf3-201ENSMUST00000088356 Rhbdl3P58873 404 aa21.94■■□□□ 1.1
Usf3-201ENSMUST00000088356 Wdr70Q3TWF6 657 aa21.94■■□□□ 1.1
Usf3-201ENSMUST00000088356 GpkowQ56A08 488 aa21.94■■□□□ 1.1
Usf3-201ENSMUST00000088356 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Usf3-201ENSMUST00000088356 ArxO35085 564 aa21.93■■□□□ 1.1
Usf3-201ENSMUST00000088356 NudcO35685 332 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Usf3-201ENSMUST00000088356 Npr3P70180 536 aa21.93■■□□□ 1.1
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